RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417400.1

CITED1-203, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, human

TSL 2

Gene CITED1, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CITED1-203	ENST00000417400	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	SYT8	Q8NBV8	401 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	COQ8A	Q8NI60	647 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	DOK5	Q9P104	306 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	AKR1C4	P17516	323 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	TNFSF8	P32971	234 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	GAMT	Q14353	236 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	ICAM4	Q14773	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	ESRG	Q1W209	222 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	PRRT1	Q99946	306 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400		Q9H3A6	140 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400		Q9H8V8	135 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400		A0A0J9YY99	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	FABP12	A6NFH5	140 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	ISLR	O14498	428 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	ATP5G1	P05496	136 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	ATP5G3	P48201	142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	CCR6	P51684	374 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	TMBIM6	P55061	237 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	LINC00315	P59091	139 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	LGI3	Q8N145	548 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	IL22RA2	Q969J5	263 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	RBKS	Q9H477	322 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	MCUB	Q9NWR8	336 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400		U3KQ87	197 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CITED1-203	ENST00000417400	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400		A0A0B4J2A0	478 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	INS	P01308	110 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	ID1	P41134	155 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	CCL18	P55774	89 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	SMCO1	Q147U7	214 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	DTD1	Q8TEA8	209 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	RSG1	Q9BU20	258 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	SLC25A22	Q9H936	323 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	RPRM	Q9NS64	109 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	ZNF98	A6NK75	572 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	ZFP92	A6NM28	416 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	PRSS46	E5RG02	174 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	VCY	O14598	125 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	PITX3	O75364	302 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	ANXA3	P12429	323 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	HTN1	P15515	57 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	TSPO	P30536	169 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	CLINT1	Q14677	625 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CITED1-203	ENST00000417400	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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