RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PKDCC-202ENST00000401498 C20orf173Q96LM9 149 aa22.22■■□□□ 1.15
PKDCC-202ENST00000401498 HRH4Q9H3N8 390 aa22.22■■□□□ 1.15
PKDCC-202ENST00000401498 RAB2AP61019 212 aa22.21■■□□□ 1.15
PKDCC-202ENST00000401498 IGFL4Q6B9Z1 124 aa22.21■■□□□ 1.15
PKDCC-202ENST00000401498 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM14CQ9P0S9 112 aa22.21■■□□□ 1.15
PKDCC-202ENST00000401498 KNCNA6PVL3 124 aa22.21■■□□□ 1.15
PKDCC-202ENST00000401498 H3BTX0 84 aa22.2■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 PYYP10082 97 aa22.2■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 DEFB1P60022 68 aa22.2■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 RHOBP62745 196 aa22.2■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 SERF2P84101 59 aa22.2■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 STOML3Q8TAV4 291 aa22.2■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF586Q9NXT0 402 aa22.19■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa22.19■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 ACTL10Q5JWF8 245 aa22.18■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 LCN15Q6UWW0 184 aa22.18■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 RNF182Q8N6D2 247 aa22.18■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 OR10G4Q8NGN3 311 aa22.18■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 OR10G9Q8NGN4 311 aa22.18■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 OR10G7Q8NGN6 311 aa22.18■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 SLC17A3O00476 420 aa22.17■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 SLC51BQ86UW2 128 aa22.17■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 LRRC20Q8TCA0 184 aa22.17■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 C4BPBP20851 252 aa22.16■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 HLA-DMBP28068 263 aa22.16■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 GDF5OSQ5U4N7 250 aa22.16■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 STHQ8IWL8 128 aa22.16■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 TPT1P13693 172 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 GUK1Q16774 197 aa22.16■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 FAM122CQ6P4D5 195 aa22.16■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 TM2D3Q9BRN9 247 aa22.16■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 OR51M1Q9H341 326 aa22.16■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 BAP18Q8IXM2 172 aa22.15■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF503Q96F45 646 aa22.15■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 SLC50A1Q9BRV3 221 aa22.15■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 RPRMQ9NS64 109 aa22.15■■□□□ 1.14
PKDCC-202ENST00000401498 TRBV19A0A075B6N1 114 aa22.14■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 A0A1W2PPV4 95 aa22.14■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 MBP02144 154 aa22.14■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 SPP1P10451 314 aa22.14■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 PAXXQ9BUH6 204 aa22.14■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 F6UB75 175 aa22.13■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 FOXI2Q6ZQN5 318 aa22.13■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 H3BMM0 161 aa22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 OR7C2O60412 319 aa22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 APOC4P55056 127 aa22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 PSG3Q16557 428 aa22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 KIR2DL5AQ8N109 375 aa22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 FXYD5Q96DB9 178 aa22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 OR10J4P0C629 311 aa22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 HLA-DRB4P13762 266 aa22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 TAS2R45P59539 299 aa22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 KHDC3LQ587J8 217 aa22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 RNF141Q8WVD5 230 aa22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa22.12■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 TENM3Q9P273 2699 aa22.11■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF253O75346 499 aa22.11■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 NDUFB4O95168 129 aa22.11■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM41BQ5BJD5 291 aa22.11■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 BLNKQ8WV28 456 aa22.11■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 CSTL1Q9H114 145 aa22.11■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 NBEAP1P0C6P0 100 aa22.1■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF738Q8NE65 137 aa22.1■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 A0A0J9YX75 114 aa22.09■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 PDE6HQ13956 83 aa22.09■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa22.09■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 SEC11BP0C7V7 166 aa22.08■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 RAB24Q969Q5 203 aa22.08■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 SPATA25Q9BR10 227 aa22.08■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 ZMAT4Q9H898 229 aa22.08■■□□□ 1.13
PKDCC-202ENST00000401498 EBLN2Q6P2I7 272 aa22.08■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 TMED6Q8WW62 240 aa22.08■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 RETNQ9HD89 108 aa22.08■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 UBE2CO00762 179 aa22.07■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 STAG3L2P0CL84 134 aa22.06■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 STAG3L3P0CL85 134 aa22.06■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa22.06■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 PQLC2Q6ZP29 291 aa22.06■■□□□ 1.12
PKDCC-202ENST00000401498 SSX7Q7RTT5 188 aa22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms