RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399396.7

N4BP2L2-204, Transcript of NEDD4 binding protein 2 like 2, human

TSL 5 BASIC

Gene N4BP2L2, Length 2,872 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
N4BP2L2-204	ENST00000399396	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	CACNA1C	Q13936	2221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	PRTN3	P24158	256 aa		4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	COL8A1	P27658	744 aa		4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	TRGV9	Q99603	122 aa		4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	UPK2	O00526	184 aa		4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	FHL3	Q13643	280 aa		4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	FRYL	O94915	3013 aa		4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	INSL3	P51460	131 aa		4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	AJUBA	Q96IF1	538 aa		4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396		A0A1W2PQF6	199 aa		4.54	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4.54	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		4.54	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	CSN3	P07498	182 aa		4.54	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	AMN1	Q8IY45	258 aa		4.54	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		4.54	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.54	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		4.54	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		4.54	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	SPEG	Q15772	3267 aa		4.54	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396		K7EM74	188 aa		4.54	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	ZZEF1	O43149	2961 aa		4.54	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	SNAI2	O43623	268 aa		4.54	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	FCGR3B	O75015	233 aa		4.54	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	CRLF1	O75462	422 aa		4.54	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	HLA-DMB	P28068	263 aa		4.54	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		4.54	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	PLGLA	Q15195	96 aa		4.54	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		4.54	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396		Q8N8P6	123 aa		4.54	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.54	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396		A0A0J9YW62	118 aa		4.53	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	HSPB6	O14558	160 aa		4.53	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	UQCRQ	O14949	82 aa		4.53	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	GP9	P14770	177 aa		4.53	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	CFHR2	P36980	270 aa		4.53	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	CXCL5	P42830	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	FOXC1	Q12948	553 aa		4.53	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	PMVK	Q15126	192 aa		4.53	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.53	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		4.53	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	PATE1	Q8WXA2	126 aa		4.53	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	LINC01587	Q99440	93 aa		4.53	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	FZR1	Q9UM11	496 aa		4.53	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.53	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396		K7ERJ3	54 aa		4.53	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	PRRG2	O14669	202 aa		4.53	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.53	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	ORM2	P19652	201 aa		4.53	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	ACP1	P24666	158 aa		4.53	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	PDE6H	Q13956	83 aa		4.53	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.53	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.53	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		4.53	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
N4BP2L2-204	ENST00000399396	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.52	□□□□□ -1.69
N4BP2L2-204	ENST00000399396	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.52	□□□□□ -1.69
N4BP2L2-204	ENST00000399396		H7C1H1	209 aa		4.52	□□□□□ -1.69
N4BP2L2-204	ENST00000399396	CEACAM4	O75871	244 aa		4.52	□□□□□ -1.69
N4BP2L2-204	ENST00000399396	MT-CO3	P00414	261 aa		4.52	□□□□□ -1.69
N4BP2L2-204	ENST00000399396	GGN	Q86UU5	652 aa		4.52	□□□□□ -1.69
N4BP2L2-204	ENST00000399396	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		4.52	□□□□□ -1.69
N4BP2L2-204	ENST00000399396	YAF2	Q8IY57	180 aa		4.52	□□□□□ -1.69
N4BP2L2-204	ENST00000399396	OR13H1	Q8NG92	308 aa		4.52	□□□□□ -1.69
N4BP2L2-204	ENST00000399396	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.52	□□□□□ -1.69
N4BP2L2-204	ENST00000399396	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
N4BP2L2-204	ENST00000399396	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.52	□□□□□ -1.69
N4BP2L2-204	ENST00000399396	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
N4BP2L2-204	ENST00000399396	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		4.52	□□□□□ -1.69
N4BP2L2-204	ENST00000399396	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.52	□□□□□ -1.69
N4BP2L2-204	ENST00000399396	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		4.52	□□□□□ -1.69
N4BP2L2-204	ENST00000399396		D6R8Y8	96 aa		4.52	□□□□□ -1.69
N4BP2L2-204	ENST00000399396		H3BT86	120 aa		4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 127.5 ms