RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 SONP18583 2426 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CTIF-202ENST00000382998 FREM3P0C091 2139 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-202ENST00000382998 CCDC168Q8NDH2 2452 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-202ENST00000382998 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CTIF-202ENST00000382998 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CTIF-202ENST00000382998 CGB1A6NKQ9 187 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-202ENST00000382998 NPYP01303 97 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-202ENST00000382998 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CTIF-202ENST00000382998 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CTIF-202ENST00000382998 RBMY1CP0DJD4 496 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-202ENST00000382998 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
CTIF-202ENST00000382998 NPCDR1Q9BY65 106 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-202ENST00000382998 CADP27708 2225 aa11.22□□□□□ -0.61
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CTIF-202ENST00000382998 IFI6P09912 130 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-202ENST00000382998 BRI3O95415 125 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-202ENST00000382998 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa11.22□□□□□ -0.61
CTIF-202ENST00000382998 MPC1Q9Y5U8 109 aa11.22□□□□□ -0.61
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CTIF-202ENST00000382998 ZG16O60844 167 aa11.21□□□□□ -0.61
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CTIF-202ENST00000382998 FAM27E3Q08E93 113 aa11.21□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 TEX45Q8NA69 505 aa11.21□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 GTSF1Q8WW33 167 aa11.21□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 FRMPD3Q5JV73 1810 aa11.21□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa11.21□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 LINC00114Q6XXX2 140 aa11.21□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 TM2D2Q9BX73 214 aa11.21□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 CFHR4Q92496 578 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 MS4A18H0YCH9 400 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 J3QRE1 110 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 CGAP01215 116 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 DSCR8Q96T75 97 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 NOTCH3Q9UM47 2321 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 PCSK4Q6UW60 755 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 ORMDL3Q8N138 153 aa11.19□□□□□ -0.62
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CTIF-202ENST00000382998 DEPPQ9NTK1 212 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 K7EMI3 77 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 IGFBP7Q16270 282 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 C3orf36Q3SXR2 165 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 RFESDQ8TAC1 157 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 PRDM14Q9GZV8 571 aa11.18□□□□□ -0.62
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CTIF-202ENST00000382998 TRAV21A0A0B4J279 112 aa11.17□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 GNLYP22749 145 aa11.17□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa11.17□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 FAM90A10PA6NDY2 464 aa11.17□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa11.17□□□□□ -0.62
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CTIF-202ENST00000382998 FAM90A24PP0C7X0 464 aa11.17□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 LEPP41159 167 aa11.17□□□□□ -0.62
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CTIF-202ENST00000382998 C6orf226Q5I0X4 101 aa11.17□□□□□ -0.62
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CTIF-202ENST00000382998 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa11.17□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa11.17□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 FASNP49327 2511 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 C4orf26Q17RF5 130 aa11.17□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 STHQ8IWL8 128 aa11.17□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 DRAM1Q8N682 238 aa11.17□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 U3KQA8 63 aa11.17□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 COX7A1P24310 79 aa11.17□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 PIP4P1Q86T03 277 aa11.17□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 PAXXQ9BUH6 204 aa11.17□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 FXYD7P58549 80 aa11.16□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 PRNTQ86SH4 94 aa11.16□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa11.16□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 C16orf92Q96LL3 132 aa11.16□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 TMEM14DPA8MWL7 114 aa11.16□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 K7ENP7 123 aa11.16□□□□□ -0.62
CTIF-202ENST00000382998 DEFA4P12838 97 aa11.16□□□□□ -0.62
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