RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373190.5

PTPRT-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-204ENST00000373190 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 PAX4O43316 350 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 Q6ZS49 121 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 PRR19A6NJB7 356 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 QRFPP83859 136 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 MMP23AO75900 390 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 FAM27E3Q08E93 113 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 PRR31Q5SQ13 230 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 C15orf62A8K5M9 175 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 COX6B1P14854 86 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 SPSB3Q6PJ21 355 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 A0A1B0GWJ7 208 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 STHQ8IWL8 128 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV3-11P01762 117 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 A0A1B0GUS0 222 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 C9JQL5 133 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 STPG1Q5TH74 334 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 NABP1Q96AH0 204 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRT-204ENST00000373190 IGLC2P0DOY2 106 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 IGLC3P0DOY3 106 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 RPL15P61313 204 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 Q86TA4 180 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 A0A1W2PR77 199 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 NTF4P34130 210 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 LINC01560Q8TB33 94 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 CSTL1Q9H114 145 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 Q6ZWC4 215 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 MYO18BQ8IUG5 2567 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 TRAV40A0A0B4J280 105 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 VWC2LB2RUY7 222 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 PDE6HQ13956 83 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 COX8AP10176 69 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 A0A1W2PPM0 123 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 ETDBQ3ZM63 59 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 TMEM75Q8N9X5 138 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 DTX1Q86Y01 620 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 PFN1P07737 140 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 FAM168AQ92567 244 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 FOXF2Q12947 444 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 LINC00473A8K010 186 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 CEP192Q8TEP8 1941 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 TRAV3A0A0B4J244 114 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 SRRM5B3KS81 715 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 CDKN1BP46527 198 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 Q8TAT8 98 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 SLAQ13239 276 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 TIMM23O14925 209 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 LILRA1O75019 489 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 SONP18583 2426 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 AZU1P20160 251 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 FGFBP3Q8TAT2 258 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 TFF1P04155 84 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 DTX2Q86UW9 622 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 SPANXCQ9NY87 97 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 SMKR1H3BMG3 65 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF876PQ49A33 203 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 C9orf106Q8NAJ2 232 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 RASL10AQ92737 203 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 PSPNO60542 156 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 IGLV3-19P01714 112 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 LY6G5BQ8NDX9 201 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 ARMS2P0C7Q2 107 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 CEND1Q8N111 149 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 CD24P25063 80 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 ERCC8Q13216 396 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 LINC00477Q96M19 166 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 KIAA1671Q9BY89 1806 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 C10orf55Q5SWW7 151 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 BDP1A6H8Y1 2624 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 SPXQ9BT56 116 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 LIME1Q9H400 295 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 LTBP1Q14766 1721 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-204ENST00000373190 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
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