RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 RNF126Q9BV68 326 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 OVOL3O00110 214 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 A0A0J9YY99 117 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 A0A1B0GTI1 187 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 MDS2Q8NDY4 140 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 DSCAML1Q8TD84 2053 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 ZNF581Q9P0T4 197 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 DKK4Q9UBT3 224 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 TMEM158Q8WZ71 300 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 ZMAT4Q9H898 229 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 MTURNQ8N3F0 131 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 ATP6V0BQ99437 205 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 A0A0G2JMZ2 1700 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 LRRC37A2A6NM11 1700 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 EFNA2O43921 213 aa8.62□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 AZU1P20160 251 aa8.62□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 IFITM2Q01629 132 aa8.62□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 hADV29S1A0JD25 119 aa8.62□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 IGKV1-5P01602 117 aa8.62□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 C5orf63A6NC05 138 aa8.62□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa8.62□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.62□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 ZNF479Q96JC4 524 aa8.62□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 RASL10AQ92737 203 aa8.62□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 A0A1B0GW15 77 aa8.62□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 C22orf46C9J442 243 aa8.62□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 A0A1W2PRE2 83 aa8.61□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 RASL11AQ6T310 242 aa8.61□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 GGNQ86UU5 652 aa8.61□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 KLF12Q9Y4X4 402 aa8.61□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.61□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 PMVKQ15126 192 aa8.61□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 E7EQL1 145 aa8.61□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 AMN1Q8IY45 258 aa8.61□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 NABP1Q96AH0 204 aa8.61□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 TMEM238C9JI98 176 aa8.61□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 RS1O15537 224 aa8.61□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 WDR90Q96KV7 1748 aa8.61□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 LINC00479Q96M42 142 aa8.61□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa8.61□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 DTX1Q86Y01 620 aa8.61□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa8.61□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 H0YJW9 148 aa8.61□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 IGKV1-39P01597 117 aa8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 IGKV1D-39P04432 117 aa8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 GUSBP1Q15486 140 aa8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 NUP35Q8NFH5 326 aa8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 PLXNA3P51805 1871 aa8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 J3QW42 95 aa8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 CFHR2P36980 270 aa8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 MED12LQ86YW9 2145 aa8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 G3V318 75 aa8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 SIGMAR1Q99720 223 aa8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 MED13Q9UHV7 2174 aa8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 IL18BPO95998 194 aa8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 IGKV1D-12P01611 117 aa8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 TREML4Q6UXN2 200 aa8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 RPRMLQ8N4K4 120 aa8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 GAFA1Q96PS6 74 aa8.6□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 TSKUQ8WUA8 353 aa8.59□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa8.59□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 RNF222A6NCQ9 220 aa8.59□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 MST1P26927 711 aa8.59□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 PSG3Q16557 428 aa8.59□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 Q6ZQT7 251 aa8.59□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 RNF144BQ7Z419 303 aa8.59□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 LINC01619G3V211 115 aa8.59□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 VCYO14598 125 aa8.59□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 KLHDC3Q9BQ90 382 aa8.59□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 ATP6V0E1O15342 81 aa8.59□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 IGKV1-16P04430 117 aa8.59□□□□□ -1.03
CLN8-201ENST00000331222 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.58□□□□□ -1.04
CLN8-201ENST00000331222 MSMBP08118 114 aa8.58□□□□□ -1.04
CLN8-201ENST00000331222 TAL2Q16559 108 aa8.58□□□□□ -1.04
CLN8-201ENST00000331222 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.58□□□□□ -1.04
CLN8-201ENST00000331222 SIGLEC9Q9Y336 463 aa8.58□□□□□ -1.04
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