RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 NAV2Q8IVL1 2488 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 D6R8Y8 96 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 H3BTX0 84 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 K7EQM0 130 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 SLC25A17O43808 307 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 CRYGBP07316 175 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 PPIAL4GP0DN37 164 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 RITA1Q96K30 269 aa8.93□□□□□ -0.98
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GINS3-202ENST00000328514 HILPDAQ9Y5L2 63 aa8.93□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 URB1O60287 2271 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
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GINS3-202ENST00000328514 K7EM74 188 aa8.92□□□□□ -0.98
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GINS3-202ENST00000328514 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.92□□□□□ -0.98
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GINS3-202ENST00000328514 HCP5Q6MZN7 132 aa8.92□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.92□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 Q71RC1 249 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.92□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 TNFRSF14Q92956 283 aa8.92□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 ZMAT4Q9H898 229 aa8.92□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.92□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 SMPXQ9UHP9 88 aa8.92□□□□□ -0.98
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GINS3-202ENST00000328514 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 M0R1B8 84 aa8.92□□□□□ -0.98
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GINS3-202ENST00000328514 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.92□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 CLEC2AQ6UVW9 174 aa8.92□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.92□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
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GINS3-202ENST00000328514 NGBQ9NPG2 151 aa8.92□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.92□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 DSPP15924 2871 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
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GINS3-202ENST00000328514 NDUFS7O75251 213 aa8.91□□□□□ -0.98
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GINS3-202ENST00000328514 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa8.91□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 FOXI2Q6ZQN5 318 aa8.91□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 WFDC8Q8IUA0 241 aa8.91□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 PCP2Q8IVA1 136 aa8.91□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.91□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 CEP295Q9C0D2 2601 aa8.91□□□□□ -0.98
GINS3-202ENST00000328514 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa8.9□□□□□ -0.98
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GINS3-202ENST00000328514 HES3Q5TGS1 186 aa8.9□□□□□ -0.98
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GINS3-202ENST00000328514 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa8.9□□□□□ -0.99
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GINS3-202ENST00000328514 H3BRN7 92 aa8.9□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 I3L2K1 104 aa8.9□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 FCN3O75636 299 aa8.9□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 DLX6P56179 175 aa8.9□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 SEM1Q6ZVN7 128 aa8.9□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 RAB37Q96AX2 223 aa8.9□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.89□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 TEX22C9J3V5 150 aa8.89□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 NKX2-8O15522 239 aa8.89□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 CEACAM4O75871 244 aa8.89□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 IGKV1-17P01599 117 aa8.89□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 PDE6HQ13956 83 aa8.89□□□□□ -0.99
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GINS3-202ENST00000328514 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.89□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 PRSS57Q6UWY2 283 aa8.89□□□□□ -0.99
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GINS3-202ENST00000328514 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.89□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 PLCE1Q9P212 2302 aa8.89□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 TRAV17A0A0B4J275 112 aa8.88□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.88□□□□□ -0.99
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GINS3-202ENST00000328514 FTH1P19P0C7X4 201 aa8.88□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 NMUP48645 174 aa8.88□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 NUP37Q8NFH4 326 aa8.88□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 SIGMAR1Q99720 223 aa8.88□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 SIGLEC9Q9Y336 463 aa8.88□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa8.88□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa8.88□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 TMEM213A2RRL7 107 aa8.88□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 WT1P19544 449 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
GINS3-202ENST00000328514 EVI2AP22794 236 aa8.88□□□□□ -0.99
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