RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 RAB9AP51151 201 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 HIST1H2BDP58876 126 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 RPL15P61313 204 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 HIST1H2BCP62807 126 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 HIST2H2BEQ16778 126 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 FAM231DQ6ZW35 169 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 FRZBQ92765 325 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 HIST1H2BHQ93079 126 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 HIST1H2BNQ99877 126 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 HIST1H2BMQ99879 126 aa20.74■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF320A2RRD8 509 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 LTAP01374 205 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 SGK494Q96LW2 274 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 CLPSL1A2RUU4 121 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 CFHR3Q02985 330 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 NIT2Q9NQR4 276 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 IGLV1-40P01703 118 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 Q6YL49 198 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 MLST8Q9BVC4 326 aa20.72■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 TRGC1P0CF51 173 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 PSG9Q00887 426 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 Q86TA4 180 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 AAMDCQ9H7C9 122 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 VPREB3Q9UKI3 123 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 ITPR3Q14573 2671 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 PF4V1P10720 104 aa20.7■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 FOXC2Q99958 501 aa20.7■□□□□ 0.91
HOXD8-201ENST00000313173 BUB3O43684 328 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 ARL3P36405 182 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 ACTL10Q5JWF8 245 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF253O75346 499 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 IGLV2-11P01706 119 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 METTL26Q96S19 204 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 KLK15Q9H2R5 256 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM75Q8N9X5 138 aa20.68■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 SERTAD4Q9NUC0 356 aa20.68■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 K7EQM0 130 aa20.68■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 PRDM13Q9H4Q3 707 aa20.68■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 DIRC3C9JPN6 131 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 GATCO43716 136 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 NDUFA6P56556 154 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 C1orf194Q5T5A4 169 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 PRR27Q6MZM9 219 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 NUDT10Q8NFP7 164 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 NUDT11Q96G61 164 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 ZFHX3Q15911 3703 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 HOXA5P20719 270 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM95Q3KNT9 176 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 A0A087X0K7 114 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 A0A0G2JLM5 398 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 LINC00587B1AMM8 73 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 M0R3E3 92 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM183AQ8IXX5 376 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF492Q9P255 531 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 U3KQE9 123 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 TRBV12-3P01733 135 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 PRNTQ86SH4 94 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 CSN1S1P47710 185 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 GRAMD2BQ96HH9 432 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD8-201ENST00000313173 AKAP9Q99996 3911 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 TEX15Q9BXT5 2789 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 IGHV3-11P01762 117 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 PSG3Q16557 428 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 LURAP1LQ8IV03 231 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 NDUFA4O00483 81 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 IGHG4P01861 327 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF785A8K8V0 405 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 OR4X2Q8NGF9 303 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 PSG8Q9UQ74 426 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 CA1P00915 261 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 APOHP02749 345 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 TCL1AP56279 114 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 RPL19P84098 196 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 LCNL1Q6ZST4 164 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 ZFP30Q9Y2G7 519 aa20.62■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM89A2RUT3 159 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 C19orf71A6NCJ1 209 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 PRSS22Q9GZN4 317 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 PSMB8P28062 276 aa20.61■□□□□ 0.89
HOXD8-201ENST00000313173 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms