RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 H3BVH4 76 aa11.61□□□□□ -0.55
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PTPRN-201ENST00000295718 MBD6Q96DN6 1003 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRN-201ENST00000295718 IGLV1-44P01699 117 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRN-201ENST00000295718 ERCC8Q13216 396 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRN-201ENST00000295718 WNK1Q9H4A3 2382 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRN-201ENST00000295718 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
PTPRN-201ENST00000295718 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
PTPRN-201ENST00000295718 ADIPOQQ15848 244 aa11.53□□□□□ -0.56
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