RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.16□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa7.16□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 PRM2P04554 102 aa7.16□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 AZU1P20160 251 aa7.16□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 VAMP1P23763 118 aa7.16□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 CYCSP99999 105 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 OR5I1Q13606 314 aa7.16□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.16□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 AARDQ4LEZ3 155 aa7.16□□□□□ -1.26
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USP41-201ENST00000292729 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 C16orf74Q96GX8 76 aa7.16□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 C16orf92Q96LL3 132 aa7.16□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 PBDC1Q9BVG4 233 aa7.16□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa7.16□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa7.15□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 NXPH3O95157 252 aa7.15□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 AKR1C4P17516 323 aa7.15□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 CXCL3P19876 107 aa7.15□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 GCSHP23434 173 aa7.15□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 TAS2R60P59551 318 aa7.15□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.15□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 FAM219AQ8IW50 185 aa7.15□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 OR8I2Q8N0Y5 310 aa7.15□□□□□ -1.26
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USP41-201ENST00000292729 ACY3Q96HD9 319 aa7.15□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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USP41-201ENST00000292729 NAA60Q9H7X0 242 aa7.15□□□□□ -1.26
USP41-201ENST00000292729 A0A087WTM6 91 aa7.14□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 M0R2Z0 102 aa7.14□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 GOSR2O14653 212 aa7.14□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 SIVA1O15304 175 aa7.14□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 PET100P0DJ07 73 aa7.14□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 CNN1P51911 297 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 PIGPP57054 158 aa7.14□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 TMEM144Q7Z5S9 345 aa7.14□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 OR2T35Q8NGX2 323 aa7.14□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 C20orf173Q96LM9 149 aa7.14□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 TP53RKQ96S44 253 aa7.14□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 LINC01587Q99440 93 aa7.14□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 NMES1Q9C002 83 aa7.14□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 A0A0G2JRQ6 117 aa7.13□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 A0A0J9YY99 117 aa7.13□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa7.13□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 HMSDA8MTL9 139 aa7.13□□□□□ -1.27
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USP41-201ENST00000292729 BAP18Q8IXM2 172 aa7.13□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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USP41-201ENST00000292729 UCP1P25874 307 aa7.12□□□□□ -1.27
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USP41-201ENST00000292729 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.12□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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USP41-201ENST00000292729 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.12□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.11□□□□□ -1.27
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USP41-201ENST00000292729 CEBPZOSA8MTT3 80 aa7.11□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 G3V3Q6 166 aa7.11□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 RGS13O14921 159 aa7.11□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.11□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 HTN1P15515 57 aa7.11□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 HOXA5P20719 270 aa7.11□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 LYZP61626 148 aa7.11□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 ZNF345Q14585 488 aa7.11□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 NMSQ5H8A3 153 aa7.11□□□□□ -1.27
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USP41-201ENST00000292729 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.1□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 C5orf51A6NDU8 294 aa7.1□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 CDS2O95674 445 aa7.1□□□□□ -1.27
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USP41-201ENST00000292729 S100A7P31151 101 aa7.1□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 ZNF90Q03938 601 aa7.1□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 GAMTQ14353 236 aa7.1□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 SP6Q3SY56 376 aa7.1□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 OR4D5Q8NGN0 318 aa7.1□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.1□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 C2orf50Q96LR7 162 aa7.1□□□□□ -1.27
USP41-201ENST00000292729 GPR82Q96P67 336 aa7.1□□□□□ -1.27
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