RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239223.3

DUSP1-201, Transcript of dual specificity phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DUSP1, Length 2,019 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1-201ENST00000239223 NAT8Q9UHE5 227 aa14.69□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 ZNF320A2RRD8 509 aa14.68□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 NDUFA4O00483 81 aa14.68□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 NBEAP1P0C6P0 100 aa14.68□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 CD28P10747 220 aa14.68□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 FABP9Q0Z7S8 132 aa14.68□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 DUX3Q96PT4 197 aa14.68□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 SELENOKQ9Y6D0 94 aa14.68□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 SCO2A0A1W2PP80 73 aa14.68□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 SMIM6P0DI80 62 aa14.68□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 IGLC2P0DOY2 106 aa14.68□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 S100A12P80511 92 aa14.68□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 FAM209BQ5JX69 171 aa14.68□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 TMEM190Q8WZ59 177 aa14.68□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 DERL1Q9BUN8 251 aa14.68□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 TMEM14CQ9P0S9 112 aa14.68□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 SLC17A3O00476 420 aa14.67□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 BUB3O43684 328 aa14.67□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 RANP62826 216 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 TMEM241Q24JQ0 296 aa14.67□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 TM4SF20Q53R12 229 aa14.67□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 STXBP6Q8NFX7 210 aa14.67□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa14.67□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 VWFP04275 2813 aa14.67□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 CRYBB3P26998 211 aa14.66□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa14.66□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 METTL26Q96S19 204 aa14.66□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 NDUFB4O95168 129 aa14.66□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 NDUFA7O95182 113 aa14.66□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 ZNF674Q2M3X9 581 aa14.66□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 OR8I2Q8N0Y5 310 aa14.66□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 SMIM7Q9BQ49 75 aa14.66□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 ELOVL1Q9BW60 279 aa14.66□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 U3KQE9 123 aa14.66□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 RNF114Q9Y508 228 aa14.65□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 A0A1W2PRE2 83 aa14.65□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 A0A1W2PRX2 142 aa14.65□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 PCP4L1A6NKN8 68 aa14.65□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 RPEL1Q2QD12 228 aa14.65□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa14.65□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa14.65□□□□□ -0.06
DUSP1-201ENST00000239223 CXCL1P09341 107 aa14.64□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 MYCNOSP40205 109 aa14.64□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 PROK1P58294 105 aa14.64□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa14.64□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 PARLQ9H300 379 aa14.64□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 TRBV19A0A075B6N1 114 aa14.63□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 SLURP1P55000 103 aa14.63□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 C8orf86Q6ZUL3 223 aa14.63□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 OR4F17Q8NGA8 305 aa14.63□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 FAM210BQ96KR6 192 aa14.63□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa14.63□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa14.63□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 SYNJ2BPP57105 145 aa14.63□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 GNG5P63218 68 aa14.63□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 GPHB5Q86YW7 130 aa14.63□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 C4orf3Q8WVX3 66 aa14.63□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 TXNDC17Q9BRA2 123 aa14.63□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa14.62□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 PDE6DO43924 150 aa14.62□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 KRTAP10-3P60369 221 aa14.62□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 IGFL4Q6B9Z1 124 aa14.62□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 Q9H3A6 140 aa14.62□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 RPL7P18124 248 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 HOXA5P20719 270 aa14.61□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 S100A7AQ86SG5 101 aa14.61□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 OR11H1Q8NG94 326 aa14.61□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 PGPA6NDG6 321 aa14.61□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 ADIRFQ15847 76 aa14.61□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 FAM106AQ4KMX7 169 aa14.61□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa14.61□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 ANAPC16Q96DE5 110 aa14.61□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 LINC00479Q96M42 142 aa14.61□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa14.6□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 TMEM213A2RRL7 107 aa14.6□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 C16orf54Q6UWD8 224 aa14.6□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 GLMPQ8WWB7 406 aa14.6□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa14.6□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 PGPEP1LA6NFU8 196 aa14.59□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 F6UZH7 168 aa14.59□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 S100PP25815 95 aa14.59□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 HLA-DMBP28068 263 aa14.59□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 C11orf52Q96A22 123 aa14.59□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 RPH3ALQ9UNE2 315 aa14.59□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa14.59□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 RPL23P62829 140 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
DUSP1-201ENST00000239223 M0R3E3 92 aa14.58□□□□□ -0.08
DUSP1-201ENST00000239223 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
DUSP1-201ENST00000239223 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa14.58□□□□□ -0.08
DUSP1-201ENST00000239223 OR1N2Q8NGR9 330 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms