RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000064724.7

CLDN11-201, Transcript of claudin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN11, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-201ENST00000064724 TACC2O95359 2948 aa13.58□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 CHEK1O14757 476 aa13.57□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 LCN12Q6JVE5 192 aa13.57□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 SIRPDQ9H106 197 aa13.57□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 UQCR10Q9UDW1 63 aa13.57□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 RELNP78509 3460 aa13.57□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 CRIP1P50238 77 aa13.56□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 PRR31Q5SQ13 230 aa13.56□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 FAM120AOSQ5T036 256 aa13.56□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 GATD1Q8NB37 220 aa13.56□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 A0A1B0GUT8 65 aa13.56□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 A0A1W2PPR1 153 aa13.56□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 M0R3E3 92 aa13.56□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 NDUFB8O95169 186 aa13.56□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 Q56UQ5 140 aa13.56□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa13.56□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 KLHDC1Q8N7A1 406 aa13.56□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa13.55□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 CYB5R2Q6BCY4 276 aa13.55□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 AAMDCQ9H7C9 122 aa13.55□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa13.55□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 A0A1B0GW15 77 aa13.55□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 CRXO43186 299 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 TMEM11P17152 192 aa13.55□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 Q6AWC8 147 aa13.55□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 C1RLQ9NZP8 487 aa13.55□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 CTSGP08311 255 aa13.54□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 LINC00614P0C842 121 aa13.54□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 RIGQ13278 110 aa13.54□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 COX8CQ7Z4L0 72 aa13.54□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 TXN2Q99757 166 aa13.54□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa13.54□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 C20orf202A1L168 122 aa13.54□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 PSG9Q00887 426 aa13.54□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 Q8N9W7 124 aa13.54□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 TMEM70Q9BUB7 260 aa13.54□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa13.53□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 M0QZ24 198 aa13.53□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 ARMS2P0C7Q2 107 aa13.53□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 RPL7P18124 248 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 KLK9Q2XQG4 91 aa13.53□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 KLK9Q9UKQ9 250 aa13.53□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 IGF2RP11717 2491 aa13.53□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 SCGB2A1O75556 95 aa13.52□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 FAM106CPP0CH98 169 aa13.52□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 CSN1S1P47710 185 aa13.52□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 AJUBAQ96IF1 538 aa13.52□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 ASCL2Q99929 193 aa13.52□□□□□ -0.24
CLDN11-201ENST00000064724 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 OR2T8A6NH00 312 aa13.52□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 NDUFS7O75251 213 aa13.52□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 ATOH7Q8N100 152 aa13.52□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 CLEC5AQ9NY25 188 aa13.52□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa13.51□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 OR5AL1P0C617 328 aa13.51□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 CT45A10P0DMU9 189 aa13.51□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 UBE2E1P51965 193 aa13.51□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 MAJINQ3KP22 176 aa13.51□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 SPATA12Q7Z6I5 190 aa13.51□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 C8orf49Q96NF6 230 aa13.51□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 IGHV3-23P01764 117 aa13.51□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 NBASA2RRP1 2371 aa13.5□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 EFNA4P52798 201 aa13.5□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 Q6ZN92 141 aa13.5□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 RABAC1Q9UI14 185 aa13.5□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 LEPROTL1O95214 131 aa13.49□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 NHLH1Q02575 133 aa13.49□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa13.49□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF493Q6ZR52 646 aa13.49□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa13.49□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa13.49□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 IGLL1P15814 213 aa13.48□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 S100A7P31151 101 aa13.48□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa13.48□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 LPAR2Q9HBW0 351 aa13.48□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 ATRXP46100 2492 aa13.48□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 IGHG4P01861 327 aa13.48□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF502Q8TBZ5 544 aa13.48□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 PRR25Q96S07 402 aa13.48□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 SH2D1AO60880 128 aa13.47□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 TSPOP30536 169 aa13.47□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 LMO4P61968 165 aa13.47□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 LINC00173Q6ZV60 143 aa13.47□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa13.47□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 TMEM189A5PLL7 270 aa13.47□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF138P52744 262 aa13.47□□□□□ -0.25
CLDN11-201ENST00000064724 BATFQ16520 125 aa13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.2 ms