RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619590.1

AMD1-208, Transcript of adenosylmethionine decarboxylase 1, human

TSL 2

Gene AMD1, Length 4,329 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AMD1-208	ENST00000619590	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	ATP6V0B	Q99437	205 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590		A6NDX4	124 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	PDE6H	Q13956	83 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	MBD6	Q96DN6	1003 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	ZNF738	Q8NE65	137 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590		H3BRN7	92 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	IGHV4-59	P01825	116 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	OSTC	Q9NRP0	149 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	MT-ND6	P03923	174 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	ADM	P35318	185 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	RIG	Q13278	110 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	IMMP2L	Q96T52	175 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	IL36B	Q9NZH7	164 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	MED13L	Q71F56	2210 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	IGHG2	P01859	326 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	RNF224	P0DH78	156 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	TCL1A	P56279	114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	LINC01551	Q86U37	167 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	IGKV1-17	P01599	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	TCRA	P04437	139 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	ELANE	P08246	267 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	GNG5	P63218	68 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	SMIM12	Q96EX1	92 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	NDUFA4	O00483	81 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	ISLR	O14498	428 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	SRD5A1	P18405	259 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	MFAP2	P55001	183 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	NDP	Q00604	133 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590		A0A0C4DFX4	3053 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	TMEM89	A2RUT3	159 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	TMEM189	A5PLL7	270 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	AJUBA	Q96IF1	538 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	SPINK4	O60575	86 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	ORM1	P02763	201 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	S100A12	P80511	92 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	SGK494	Q96LW2	274 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	DERL1	Q9BUN8	251 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	HCFC1	P51610	2035 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AMD1-208	ENST00000619590	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AMD1-208	ENST00000619590	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AMD1-208	ENST00000619590	VCAN	P13611	3396 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AMD1-208	ENST00000619590	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AMD1-208	ENST00000619590	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AMD1-208	ENST00000619590	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AMD1-208	ENST00000619590	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AMD1-208	ENST00000619590	TMEM86B	Q8N661	226 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AMD1-208	ENST00000619590	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AMD1-208	ENST00000619590	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62

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