RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616306.1

UBXN8-208, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN8, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-208ENST00000616306 ISLRO14498 428 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 SOCS3O14543 225 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 TSC22D2O75157 780 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 HLA-DRB4P13762 266 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 PAX9P55771 341 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 SELENOTP62341 195 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 DLK1P80370 383 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 GPR82Q96P67 336 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 HRH4Q9H3N8 390 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 RYR2Q92736 4967 aa7.35□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF98A6NK75 572 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 GALR1P47211 349 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF846Q147U1 533 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 OR10P1Q8NGE3 313 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 S100ZQ8WXG8 99 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 TMEM147Q9BVK8 224 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 NUDT15Q9NV35 164 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 GSKIPQ9P0R6 139 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 TBC1D24Q9ULP9 559 aa7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
UBXN8-208ENST00000616306 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 SMCO3A2RU48 225 aa7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 K7EPK0 472 aa7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 SCGB1D2O95969 90 aa7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 MBPP02686 304 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 IL5P05113 134 aa7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 METTL15P1P0C7V9 234 aa7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 ORM2P19652 201 aa7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 PLP1P60201 277 aa7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 S100A7AQ86SG5 101 aa7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 GGACTQ9BVM4 153 aa7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 SLC25A32Q9H2D1 315 aa7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 MGAT4CQ9UBM8 478 aa7.33□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 TRAV6A0A075B6T7 132 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 C7orf66A4D0T2 115 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 C11orf94C9JXX5 98 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 H3BRN7 92 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 DEFB4AO15263 64 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 HYPMO75409 117 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 CCNKO75909 580 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 RAP2BP61225 183 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 GDF5OSQ5U4N7 250 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 MZT2BQ6NZ67 158 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 LINC00052Q96N35 136 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 RSG1Q9BU20 258 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 SLC25A22Q9H936 323 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 RPRMQ9NS64 109 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 XCL2Q9UBD3 114 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 RNF24Q9Y225 148 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 HIGD1AQ9Y241 93 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 A0A0J9YX75 114 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 C5orf51A6NDU8 294 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 CCSO14618 274 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 DEDDO75618 318 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 LY6G6CO95867 125 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 LINC00869P0C866 280 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 RPL7P18124 248 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 TCTAP57738 103 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 ASAH1Q13510 395 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 EBLN2Q6P2I7 272 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 C16orf92Q96LL3 132 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 C17orf77Q96MU5 243 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 NEU1Q99519 415 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 SEC22CQ9BRL7 303 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 A8MTW9 85 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 FAM25EA8MYX2 175 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 L7N2F9 121 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-208ENST00000616306 GOSR2O14653 212 aa7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms