RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590104.1

LAMA3-211, Transcript of laminin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 5

Gene LAMA3, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3-211ENST00000590104 H3BMM0 161 aa4.7□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 ISLRO14498 428 aa4.7□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 SPART-AS1P0CW21 52 aa4.7□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 P0DMU3 169 aa4.7□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 FAM231AP0DMU4 169 aa4.7□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 FAM231CP0DMU5 169 aa4.7□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 PSG1P11464 419 aa4.7□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 HLA-DRB4P13762 266 aa4.7□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 GALR1P47211 349 aa4.7□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 GAMTQ14353 236 aa4.7□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 SPCS2Q15005 226 aa4.7□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 OXA1LQ15070 435 aa4.7□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 PSMG4Q5JS54 123 aa4.7□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 EBLN2Q6P2I7 272 aa4.7□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 FOXI2Q6ZQN5 318 aa4.7□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 LINC00336Q6ZUF6 198 aa4.7□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 TOMM5Q8N4H5 51 aa4.7□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.7□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 MCFD2Q8NI22 146 aa4.7□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 LHFPL5Q8TAF8 219 aa4.7□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 ACY3Q96HD9 319 aa4.7□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 RBKSQ9H477 322 aa4.7□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa4.7□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 PKD1P98161 4303 aa4.7□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.69□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa4.69□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 KNCNA6PVL3 124 aa4.69□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 PITX3O75364 302 aa4.69□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 HLA-DMBP28068 263 aa4.69□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 SELENOTP62341 195 aa4.69□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 C4orf46Q504U0 113 aa4.69□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 PYDC2Q56P42 97 aa4.69□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 LYZL2Q7Z4W2 148 aa4.69□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 OR8I2Q8N0Y5 310 aa4.69□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 BPIFCQ8NFQ6 507 aa4.69□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 OR1B1Q8NGR6 318 aa4.69□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 PPP1R14BQ96C90 147 aa4.69□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 NDUFAF3Q9BU61 184 aa4.69□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 RPRMQ9NS64 109 aa4.69□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 APLNQ9ULZ1 77 aa4.69□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa4.69□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 RFNGQ9Y644 331 aa4.69□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa4.68□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 CENPXA8MT69 81 aa4.68□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 FNDC10F2Z333 226 aa4.68□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 SYNGR2O43760 224 aa4.68□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 SFT2D2O95562 160 aa4.68□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 IFNA21P01568 189 aa4.68□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 PAX9P55771 341 aa4.68□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 PSG9Q00887 426 aa4.68□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 SPANXN2Q5MJ10 180 aa4.68□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 PXDC1Q5TGL8 231 aa4.68□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 FAAP20Q6NZ36 180 aa4.68□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 FAM24BQ8N5W8 94 aa4.68□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 THAP8Q8NA92 274 aa4.68□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 COQ8AQ8NI60 647 aa4.68□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 TMEM170AQ8WVE7 144 aa4.68□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 PBDC1Q9BVG4 233 aa4.68□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 CLEC5AQ9NY25 188 aa4.68□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 MYCBP2O75592 4640 aa4.68□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa4.67□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 H3BMQ9 156 aa4.67□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 NXPH3O95157 252 aa4.67□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.67□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 INPP1P49441 399 aa4.67□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 TAS2R30P59541 319 aa4.67□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP4.67□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 ZNF79Q15937 498 aa4.67□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 RNF212Q495C1 297 aa4.67□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 TMEM144Q7Z5S9 345 aa4.67□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 TMED4Q7Z7H5 227 aa4.67□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 POM121L12Q8N7R1 296 aa4.67□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 LINC00052Q96N35 136 aa4.67□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 C18orf15Q96N68 181 aa4.67□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 TMEM147Q9BVK8 224 aa4.67□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 GGACTQ9BVM4 153 aa4.67□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 XCL2Q9UBD3 114 aa4.67□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 DNAH17Q9UFH2 4485 aa4.67□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 DNAH6Q9C0G6 4158 aa4.66□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa4.66□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 A0A0J9YX75 114 aa4.66□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 ZNF98A6NK75 572 aa4.66□□□□□ -1.66
LAMA3-211ENST00000590104 B5MCH6 92 aa4.66□□□□□ -1.66
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