RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589550.1

PIK3C3-211, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3-211ENST00000589550 AIF1LQ9BQI0 150 aa2.47□□□□□ -2.01
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PIK3C3-211ENST00000589550 DIP2BQ9P265 1576 aa2.45□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 FGD6Q6ZV73 1430 aa2.45□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 GREB1Q4ZG55 1949 aa2.45□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 TIMM17BO60830 172 aa2.45□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 CST7O76096 145 aa2.45□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 PROSCO94903 275 aa2.45□□□□□ -2.02
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PIK3C3-211ENST00000589550 TMEM35BQ8NCS4 154 aa2.45□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 BORCS8Q96FH0 119 aa2.45□□□□□ -2.02
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PIK3C3-211ENST00000589550 SLC50A1Q9BRV3 221 aa2.45□□□□□ -2.02
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PIK3C3-211ENST00000589550 ASB4Q9Y574 426 aa2.45□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 CCDC141Q6ZP82 1450 aa2.45□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa2.45□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 WNK3Q9BYP7 1800 aa2.45□□□□□ -2.02
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PIK3C3-211ENST00000589550 ITSN2Q9NZM3 1697 aa2.44□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa2.44□□□□□ -2.02
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PIK3C3-211ENST00000589550 ARL5CA6NH57 179 aa2.44□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 CXCL1P09341 107 aa2.44□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 MGST1P10620 155 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF846Q147U1 533 aa2.44□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 Q1T7F1 81 aa2.44□□□□□ -2.02
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PIK3C3-211ENST00000589550 C14orf132Q9NPU4 83 aa2.44□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 MYO5CQ9NQX4 1742 aa2.44□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 TECPR2O15040 1411 aa2.43□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 DAPK1P53355 1430 aa2.43□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa2.43□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa2.43□□□□□ -2.02
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PIK3C3-211ENST00000589550 KRTAP10-1P60331 282 aa2.43□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 RPS28P62857 69 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 TSC22D3Q99576 134 aa2.43□□□□□ -2.02
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PIK3C3-211ENST00000589550 MLH3Q9UHC1 1453 aa2.43□□□□□ -2.02
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PIK3C3-211ENST00000589550 PREX2Q70Z35 1606 aa2.42□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 PTPN23Q9H3S7 1636 aa2.42□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa2.42□□□□□ -2.02
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PIK3C3-211ENST00000589550 HIST1H2BJP06899 126 aa2.42□□□□□ -2.02
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PIK3C3-211ENST00000589550 S100A11P31949 105 aa2.42□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 HBBP68871 147 aa2.42□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF714Q96N38 554 aa2.42□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 NAT8BQ9UHF3 227 aa2.42□□□□□ -2.02
PIK3C3-211ENST00000589550 RNF11Q9Y3C5 154 aa2.42□□□□□ -2.02
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