RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 TTC32Q5I0X7 151 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 HES5Q5TA89 166 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 GPR107Q5VW38 600 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 C12orf73Q69YU5 71 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 CLEC19AQ6UXS0 136 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 SSX6Q7RTT6 188 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 CBR4Q8N4T8 237 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 ZFP41Q8N8Y5 198 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 DUSP18Q8NEJ0 188 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 OR10K1Q8NGX5 313 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 OR10J6PQ8NGY7 276 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 GIMAP1Q8WWP7 306 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 ABHD14BQ96IU4 210 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 SLC25A2Q9BXI2 301 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM14BQ9NUH8 114 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 KLK9Q9UKQ9 250 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 ORC6Q9Y5N6 252 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 V9GYY5 206 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 KMT2AQ03164 3969 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 ABCA13Q86UQ4 5058 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 PPP5D1E7EU14 171 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 M0R1X1 148 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF861PO60384 105 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 HRASP01112 189 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 REG1AP05451 166 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 CD36P16671 472 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 PSMD7P51665 324 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 CCL18P55774 89 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 HERVK_113P61574 105 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 HSP90B2PQ58FF3 399 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 YIF1BQ5BJH7 314 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 LPCAT4Q643R3 524 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 OR51A4Q8NGJ6 313 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 OR10AC1Q8NH08 325 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 OR10J5Q8NHC4 309 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 C18orf15Q96N68 181 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 GINS3Q9BRX5 216 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 OR51E2Q9H255 320 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 MCUBQ9NWR8 336 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP3.57□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 TRAV6A0A075B6T7 132 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 A0A1W2PPV4 95 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 PLAC8L1A1L4L8 177 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 NAPSAO96009 420 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 IFNA5P01569 189 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 IGLV2-23P01705 113 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.56□□□□□ -1.84
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PTPRM-208ENST00000578600 ARPC4P59998 168 aa3.56□□□□□ -1.84
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PTPRM-208ENST00000578600 Q8NAQ8 132 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 MITD1Q8WV92 249 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 RNF185Q96GF1 192 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 C12orf4Q9NQ89 552 aa3.56□□□□□ -1.84
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PTPRM-208ENST00000578600 DNAH10Q8IVF4 4471 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 PKHD1P08F94 4074 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 A0A1B0GW64 132 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 J3QRE1 110 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 GABARAPO95166 117 aa3.55□□□□□ -1.84
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PTPRM-208ENST00000578600 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 CTXN2P0C2S0 81 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 RPS10P46783 165 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
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PTPRM-208ENST00000578600 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 HLA-DRB3P79483 266 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 Q499Y3 187 aa3.55□□□□□ -1.84
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PTPRM-208ENST00000578600 KDM4DQ6B0I6 523 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF880Q6PDB4 577 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 CANT1Q8WVQ1 401 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 CACNG8Q8WXS5 425 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 ISOC2Q96AB3 205 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 COMMD5Q9GZQ3 224 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
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