RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567780.1

HOXC-AS3-204, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

Gene HOXC-AS3, Length 2,816 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NBR2O15453 112 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TOMM40O96008 361 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PLP1P60201 277 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C17orf77Q96MU5 243 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NCOR2Q9Y618 2525 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 K7EIM0 57 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 M0R143 59 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LTAP01374 205 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ADORA2A-AS1P86434 159 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FBLN7Q53RD9 439 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MLST8Q9BVC4 326 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CHD8Q9HCK8 2581 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LOC105371242A0A075B767 164 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HSBP1O75506 76 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IL4P05112 153 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BORCS7Q96B45 105 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A8MWL6 223 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C3orf79P0CE67 100 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 COL8A1P27658 744 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RASL11AQ6T310 242 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ATOH7Q8N100 152 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GTSF1Q8WW33 167 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OTORQ9NRC9 128 aa9.82□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC00614P0C842 121 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HBBP68871 147 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BATFQ16520 125 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NIT1Q86X76 327 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LY6G5BQ8NDX9 201 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RNF5Q99942 180 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MSRB2Q9Y3D2 182 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DLEU1O43261 78 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CEACAM3P40198 252 aa9.81□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 M0R2Z0 102 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV3-23P01764 117 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KLRB1Q12918 225 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q86TA4 180 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OR4F17Q8NGA8 305 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C20orf144Q9BQM9 153 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 M0QZ24 198 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GNG7O60262 68 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PAX2Q02962 417 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LCN12Q6JVE5 192 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q8N976 141 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CFHR4Q92496 578 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RNF125Q96EQ8 232 aa9.8□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NPSP0C0P6 89 aa9.79□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SPATA45Q537H7 98 aa9.79□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OR11H6Q8NGC7 330 aa9.79□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SMIM12Q96EX1 92 aa9.79□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM208Q9BTX3 173 aa9.79□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRSS22Q9GZN4 317 aa9.79□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A1B0GXF2 115 aa9.79□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C19orf71A6NCJ1 209 aa9.79□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C5orf64Q2M2E5 130 aa9.79□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9.79□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF491Q8N8L2 437 aa9.79□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa9.79□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM14CQ9P0S9 112 aa9.79□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRBV19A0A075B6N1 114 aa9.78□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GAGE1Q13065 139 aa9.78□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PMCHL1Q16048 86 aa9.78□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q56UQ5 140 aa9.78□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OR4B1Q8NGF8 309 aa9.78□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 M0R3E3 92 aa9.78□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NDUFS7O75251 213 aa9.78□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HLA-DRB1P01911 266 aa9.78□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRTN3P24158 256 aa9.78□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DYNAPQ8N1N2 210 aa9.78□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TPPP3Q9BW30 176 aa9.78□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CHEK1O14757 476 aa9.78□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGLV2-11P01706 119 aa9.78□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 VMO1Q7Z5L0 202 aa9.78□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF492Q9P255 531 aa9.78□□□□□ -0.84
HOXC-AS3-204ENST00000567780 H3BRN7 92 aa9.77□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OR2J3O76001 311 aa9.77□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NDPQ00604 133 aa9.77□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa9.77□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa9.77□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-204ENST00000567780 M0R1W7 72 aa9.77□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CIDEAO60543 219 aa9.77□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NPBQ8NG41 125 aa9.77□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ARPC1AQ92747 370 aa9.77□□□□□ -0.85
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms