RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		14.57	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559		H3BRN7	92 aa		14.57	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV2-11	P01706	119 aa		14.57	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		14.57	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	PRNT	Q86SH4	94 aa		14.57	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		14.57	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		14.57	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559		M0R1W7	72 aa		14.57	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	TXN2	Q99757	166 aa		14.57	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		14.57	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	SPTA1	P02549	2419 aa		14.57	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	HAX1	O00165	279 aa		14.56	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	CHEK1	O14757	476 aa		14.56	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	SIAH2	O43255	324 aa		14.56	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFA3	O95167	84 aa		14.56	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		14.56	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	RNF125	Q96EQ8	232 aa		14.56	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		14.56	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		14.56	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		14.56	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		14.56	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	CFHR4	Q92496	578 aa		14.56	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		14.55	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		14.55	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		14.54	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	C2orf70	A6NJV1	201 aa		14.54	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559		A6NNC1	897 aa		14.54	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	HLA-DRB1	P01911	266 aa		14.54	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	ARF6	P62330	175 aa		14.54	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF124	Q15973	351 aa		14.54	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZN92	141 aa		14.54	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		14.54	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	ABCA4	P78363	2273 aa		14.54	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	IL4	P05112	153 aa		14.54	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	G0S2	P27469	103 aa		14.54	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		14.54	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		14.54	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	TACC2	O95359	2948 aa		14.54	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	ZZEF1	O43149	2961 aa		14.53	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GW15	77 aa		14.53	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		14.53	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	CCL21	O00585	134 aa		14.53	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	PRTN3	P24158	256 aa		14.53	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	GAGE1	Q13065	139 aa		14.53	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	PDE6H	Q13956	83 aa		14.53	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	BATF	Q16520	125 aa		14.53	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		14.53	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	LCN12	Q6JVE5	192 aa		14.53	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		14.53	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		14.53	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	ODF3B	A8MYP8	253 aa		14.53	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559		Q56UQ5	140 aa		14.53	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		14.53	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		14.53	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		14.53	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559	C1RL	Q9NZP8	487 aa		14.53	□□□□□ -0.08
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GUT8	65 aa		14.52	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	GNG7	O60262	68 aa		14.52	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	OR5AL1	P0C617	328 aa		14.52	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	MFAP4	P55083	255 aa		14.52	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	PSG3	Q16557	428 aa		14.52	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559		Q6AWC8	147 aa		14.52	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	PSG8	Q9UQ74	426 aa		14.52	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00614	P0C842	121 aa		14.51	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	RIG	Q13278	110 aa		14.51	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	HES1	Q14469	280 aa		14.51	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		14.51	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		14.51	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		14.51	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		14.51	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	TOX4	O94842	621 aa		14.51	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		14.51	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	ATOH7	Q8N100	152 aa		14.51	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		14.51	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		14.51	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		14.5	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		14.5	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	OOSP1	A8MZH6	123 aa		14.5	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	DLEU1	O43261	78 aa		14.5	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	THYN1	Q9P016	225 aa		14.5	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	14.5	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	SCGB2A1	O75556	95 aa		14.5	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	ARPC1A	Q92747	370 aa		14.5	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	C17orf77	Q96MU5	243 aa		14.5	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		14.49	□□□□□ -0.09
RRN3-205	ENST00000563559	LEPROTL1	O95214	131 aa		14.49	□□□□□ -0.09

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