RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552189.5

SENP1-210, Transcript of SUMO specific peptidase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SENP1, Length 4,967 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1-210ENST00000552189 Q6ZRM9 215 aa6.3□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 LRTM2Q8N967 370 aa6.3□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.3□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 A0A1W2PPR1 153 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 H7C1H1 209 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 NDUFA4O00483 81 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 SCGB1D1O95968 90 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 INSP01308 110 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 CXCL2P19875 107 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 CKS2P33552 79 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 MBD6Q96DN6 1003 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 NACAE9PAV3 2078 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 A0A0G2JRQ6 117 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 PEX7O00628 323 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 ISLRO14498 428 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 IGHV3-53P01767 116 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 WT1-ASQ06250 92 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 CD300CQ08708 224 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 OTORQ9NRC9 128 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 A8MXK9 166 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 H3BUA1 57 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 TOMM40O96008 361 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 IGLV1-47P01700 117 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 GNG5P63218 68 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 Q8N9W7 124 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 Q8NFD4 153 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.29□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 Q6YL49 198 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 MYCNOSP40205 109 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 WDR73Q6P4I2 378 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 F5H768 121 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 CRLF1O75462 422 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 PMCHP20382 165 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 DAD1P61803 113 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 TMEM18Q96B42 140 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 ASCL2Q99929 193 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 GGTLC1Q9BX51 225 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 TCAPO15273 167 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 AANATQ16613 207 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 PLXNB1O43157 2135 aa6.28□□□□□ -1.4
SENP1-210ENST00000552189 CD28P10747 220 aa6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 CENPWQ5EE01 88 aa6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 CLLU1Q5K131 121 aa6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 UQCC3Q6UW78 93 aa6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 RCHY1Q96PM5 261 aa6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 AGMATQ9BSE5 352 aa6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 SEC11CQ9BY50 192 aa6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 USP24Q9UPU5 2620 aa6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 A0A087WX48 190 aa6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 KIR2DL4Q99706 377 aa6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 OR5AL1P0C617 328 aa6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 KLK15Q9H2R5 256 aa6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 C15orf62A8K5M9 175 aa6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 H3BQ15 152 aa6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 PSCAO43653 123 aa6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 ZNF253O75346 499 aa6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 PSG8Q9UQ74 426 aa6.27□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 IGHG2P01859 326 aa6.26□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 HILS1P60008 231 aa6.26□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 RNF212Q495C1 297 aa6.26□□□□□ -1.41
SENP1-210ENST00000552189 NCKAP5O14513 1909 aa6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms