RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 RBAKDNA6NC62 111 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV2-70P01814 119 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 NLRC5Q86WI3 1866 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRB-208ENST00000550358 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 C3orf56Q8N813 242 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRB-208ENST00000550358 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.87□□□□□ -1.31
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PTPRB-208ENST00000550358 Q6ZSR3 168 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.86□□□□□ -1.31
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PTPRB-208ENST00000550358 EMP1P54849 157 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 PAX2Q02962 417 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 KIAA1671Q9BY89 1806 aa6.86□□□□□ -1.31
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PTPRB-208ENST00000550358 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 C17orf58Q2M2W7 97 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 ERG28Q9UKR5 140 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1B0GWB2 263 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 EREGO14944 169 aa6.86□□□□□ -1.31
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PTPRB-208ENST00000550358 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.86□□□□□ -1.31
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PTPRB-208ENST00000550358 LEPROTO15243 131 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRB-208ENST00000550358 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM219Q86XT9 240 aa6.85□□□□□ -1.31
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PTPRB-208ENST00000550358 C15orf65H3BRN8 121 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 HIST1H2BKO60814 126 aa6.84□□□□□ -1.31
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PTPRB-208ENST00000550358 HIST1H2BOP23527 126 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 HIST1H2BBP33778 126 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 HIST1H2BDP58876 126 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 HIST1H2BCP62807 126 aa6.84□□□□□ -1.31
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PTPRB-208ENST00000550358 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.84□□□□□ -1.31
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PTPRB-208ENST00000550358 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 Q8N8P6 123 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 I3L3M4 83 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00158P58513 81 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 CD24P25063 80 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV2-5P01817 119 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 RNF223E7ERA6 249 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 FCN3O75636 299 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 TFF1P04155 84 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-208ENST00000550358 MST1LQ2TV78 715 aa6.83□□□□□ -1.32
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