RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 IGF1P05019 195 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 ASCL2Q99929 193 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 ISLRO14498 428 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 CXCL1P09341 107 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 ELOBQ15370 118 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 PRR27Q6MZM9 219 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 RABAC1Q9UI14 185 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 A0A087WWC5 75 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 A0A1W2PPQ1 181 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 H3BRN7 92 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 M0R3E3 92 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 BMPR1BO00238 502 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 SLC17A3O00476 420 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 TGOLN2O43493 480 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 RAB5AP20339 215 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 ERVFC1-1P60608 527 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 Q6YL49 198 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 SMR3AQ99954 134 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 JMJD1CQ15652 2540 aa6.52□□□□□ -1.36
CS-215ENST00000549143 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 K7EN84 100 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 PEX7O00628 323 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 ARL3P36405 182 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 SFRP2Q96HF1 295 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 GALR1P47211 349 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 RAB9AP51151 201 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 UBE2G1P62253 170 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 OR5R1Q8NH85 324 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 C11orf52Q96A22 123 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 TXN2Q99757 166 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 TUBA4BQ9H853 241 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 EPDR1Q9UM22 224 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 BAGE2Q86Y30 109 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 FAM223BA6NKX1 122 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 FSHBP01225 129 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 TEX38Q6PEX7 206 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 PRELID1Q9Y255 219 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 ZNF785A8K8V0 405 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 SPINK4O60575 86 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 IGLC2P0DOY2 106 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 S100PP25815 95 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 S100A7AQ86SG5 101 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 FAM210BQ96KR6 192 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 CXorf65A6NEN9 183 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 TCRAP04437 139 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 MYCNOSP40205 109 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 SLC35B1P78383 322 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 C1QL4Q86Z23 238 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 METTL26Q96S19 204 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 C1orf196B1AJZ1 125 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 HLA-DMBP28068 263 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 TCL1AP56279 114 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 PRNTQ86SH4 94 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 FOXC2Q99958 501 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 ATG101Q9BSB4 218 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-215ENST00000549143 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.49□□□□□ -1.37
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