RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM170AQ8WVE7 144 aa4.14□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 LINC00052Q96N35 136 aa4.14□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 NMES1Q9C002 83 aa4.14□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC25A22Q9H936 323 aa4.14□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 UQCC1Q9NVA1 299 aa4.14□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 TBC1D24Q9ULP9 559 aa4.14□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa4.14□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 SELENOKQ9Y6D0 94 aa4.14□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 MUC4Q99102 2169 aa4.14□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A0J9YWU9 116 aa4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 C7orf66A4D0T2 115 aa4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 E5RGE8 158 aa4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 C17orf112F2Z3M2 114 aa4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 K7EPK0 472 aa4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 MBPP02686 304 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 HLA-DRB4P13762 266 aa4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 CAMLGP49069 296 aa4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 BAXQ07812 192 aa4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC38A11Q08AI6 406 aa4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 GUK1Q16774 197 aa4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 C10orf113Q5VZT2 155 aa4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 ZFAND6Q6FIF0 208 aa4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 LCN15Q6UWW0 184 aa4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 OR4B1Q8NGF8 309 aa4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 C11orf45Q8TAV5 145 aa4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 CLUHP3Q96NS8 147 aa4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC50A1Q9BRV3 221 aa4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM208Q9BTX3 173 aa4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 RSG1Q9BU20 258 aa4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 ARL6Q9H0F7 186 aa4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 HRH4Q9H3N8 390 aa4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 RETNQ9HD89 108 aa4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa4.12□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 A6NHS1 94 aa4.12□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 PRSS46E5RG02 174 aa4.12□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 H3BMM0 161 aa4.12□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 AGPAT2O15120 278 aa4.12□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 TSPOP30536 169 aa4.12□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 PSG9Q00887 426 aa4.12□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 FGL1Q08830 312 aa4.12□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 LINC00305Q7Z4B0 112 aa4.12□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 OR10J6PQ8NGY7 276 aa4.12□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 ASB13Q8WXK3 278 aa4.12□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 SEC22CQ9BRL7 303 aa4.12□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa4.12□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 DOK5Q9P104 306 aa4.12□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 PXMP4Q9Y6I8 212 aa4.12□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.12□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A087X0K7 114 aa4.11□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 KNCNA6PVL3 124 aa4.11□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 H3BRN7 92 aa4.11□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 IFNA5P01569 189 aa4.11□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 HBE1P02100 147 aa4.11□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 SPART-AS1P0CW21 52 aa4.11□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 RPL29P47914 159 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 PAX9P55771 341 aa4.11□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 PMS2P11Q13670 270 aa4.11□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 PDE6HQ13956 83 aa4.11□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM256Q8N2U0 113 aa4.11□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF738Q8NE65 137 aa4.11□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 THAP6Q8TBB0 222 aa4.11□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 SCGB1C1Q8TD33 95 aa4.11□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 C2CD4CQ8TF44 421 aa4.11□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 CHAC2Q8WUX2 184 aa4.11□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 NEU1Q99519 415 aa4.11□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 MARVELD1Q9BSK0 173 aa4.11□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 ARV1Q9H2C2 271 aa4.11□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC25A32Q9H2D1 315 aa4.11□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 RFNGQ9Y644 331 aa4.11□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa4.11□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa4.1□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 TRAV10A0A0B4J240 114 aa4.1□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A0J9YX75 114 aa4.1□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 CCSO14618 274 aa4.1□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF253O75346 499 aa4.1□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 CST7O76096 145 aa4.1□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 PTTG1O95997 202 aa4.1□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 INSP01308 110 aa4.1□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 FGF7P21781 194 aa4.1□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 TAS2R45P59539 299 aa4.1□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 RHOBP62745 196 aa4.1□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 RAB32Q13637 225 aa4.1□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 PSG3Q16557 428 aa4.1□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 RRN3P1Q2M238 152 aa4.1□□□□□ -1.75
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