RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531188.5

RPS3-217, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS3, Length 2,097 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-217ENST00000531188 SLC25A33Q9BSK2 321 aa9.62□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 WNT10AQ9GZT5 417 aa9.62□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 K7EP13 123 aa9.62□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 TOMM40O96008 361 aa9.62□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 STAG3L2P0CL84 134 aa9.62□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 STAG3L3P0CL85 134 aa9.62□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 RAB31Q13636 194 aa9.62□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 SPATA45Q537H7 98 aa9.62□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 ASPHD1Q5U4P2 390 aa9.62□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 ZNF562Q6V9R5 426 aa9.62□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa9.62□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa9.62□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 OR1L6Q8NGR2 347 aa9.62□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 PIFOQ8TCI5 191 aa9.62□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa9.62□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 PDZD2O15018 2839 aa9.61□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 ITPR2Q14571 2701 aa9.61□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa9.61□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 CRYGCP07315 174 aa9.61□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 OR5G3P0C626 314 aa9.61□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 IGLC2P0DOY2 106 aa9.61□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 IGLC3P0DOY3 106 aa9.61□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 PTTG1IPP53801 180 aa9.61□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 RPEL1Q2QD12 228 aa9.61□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 TMEM219Q86XT9 240 aa9.61□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 Q8N976 141 aa9.61□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 OCC1Q8TAD7 63 aa9.61□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 ARPC1AQ92747 370 aa9.61□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 C11orf52Q96A22 123 aa9.61□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 TXN2Q99757 166 aa9.61□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 DERL1Q9BUN8 251 aa9.61□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 FBXL7Q9UJT9 491 aa9.61□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 ITPR3Q14573 2671 aa9.61□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 SNURFLB1AK76 121 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 MT-CO2P00403 227 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 TGFAP01135 160 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 CD33P20138 364 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 CDKN1BP46527 198 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 TFPI2P48307 235 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 UBE2G2P60604 165 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 RBX1P62877 108 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 KCNS1Q96KK3 526 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 Q96MF0 132 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 UBE2V1Q13404 147 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 MEGF9Q9H1U4 602 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 C1RLQ9NZP8 487 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 HYPMO75409 117 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 NDUFB8O95169 186 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 OR10J4P0C629 311 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 IGHV4-31P0DP07 118 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 KRTDAPP60985 99 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 PMCHL1Q16048 86 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 Q6ZN92 141 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 THAP8Q8NA92 274 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 ZNF738Q8NE65 137 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 UHRF2Q96PU4 802 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 RASL11BQ9BPW5 248 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 NRN1Q9NPD7 142 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 PGPEP1LA6NFU8 196 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 LINC01548A6NM66 108 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 I3L2K1 104 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 HLA-DRB1P01911 266 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 GATA3P23771 443 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 AMTP48728 403 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 STPG4Q8N801 248 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 MBD6Q96DN6 1003 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS3-217ENST00000531188 CCDC168Q8NDH2 2452 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-217ENST00000531188 SCO2A0A1W2PP80 73 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-217ENST00000531188 CORTO00230 105 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-217ENST00000531188 ARL14EPLP0DKL9 152 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-217ENST00000531188 IER3P46695 156 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-217ENST00000531188 ETFRF1Q6IPR1 90 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-217ENST00000531188 GNB4Q9HAV0 340 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-217ENST00000531188 CREBBPQ92793 2442 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS3-217ENST00000531188 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa9.57□□□□□ -0.88
RPS3-217ENST00000531188 K7EIM0 57 aa9.57□□□□□ -0.88
RPS3-217ENST00000531188 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
RPS3-217ENST00000531188 LY6EQ16553 131 aa9.57□□□□□ -0.88
RPS3-217ENST00000531188 MIR17HGQ75NE6 70 aa9.57□□□□□ -0.88
RPS3-217ENST00000531188 C5orf56Q8N8D9 126 aa9.57□□□□□ -0.88
RPS3-217ENST00000531188 TMEM116Q8NCL8 245 aa9.57□□□□□ -0.88
RPS3-217ENST00000531188 FANCD2OSQ96PS1 177 aa9.57□□□□□ -0.88
RPS3-217ENST00000531188 COX11Q9Y6N1 276 aa9.57□□□□□ -0.88
RPS3-217ENST00000531188 S4R3C0 116 aa9.57□□□□□ -0.88
RPS3-217ENST00000531188 MXRA5Q9NR99 2828 aa9.57□□□□□ -0.88
RPS3-217ENST00000531188 NPIPB5A8MRT5 1133 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms