RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZFHX3Q15911 3703 aa6.49□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM213A2RRL7 107 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C2orf70A6NJV1 201 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF785A8K8V0 405 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BUB3O43684 328 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NMBP08949 121 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR10J4P0C629 311 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 STAG3L2P0CL84 134 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 STAG3L3P0CL85 134 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FOLR2P14207 255 aa6.48□□□□□ -1.37
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EDN2P20800 178 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CBLN1P23435 193 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLLU1Q5K131 121 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IL34Q6ZMJ4 242 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MARC2Q969Z3 335 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 U3KQE9 123 aa6.48□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.47□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A8MWP6 167 aa6.47□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CHEK1O14757 476 aa6.47□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PYYP10082 97 aa6.47□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GCHFRP30047 84 aa6.47□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GALR1P47211 349 aa6.47□□□□□ -1.37
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.47□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.47□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.47□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.47□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BLNKQ8WV28 456 aa6.47□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPR82Q96P67 336 aa6.47□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.47□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CUBNO60494 3623 aa6.46□□□□□ -1.37
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.46□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HELTA6NFD8 242 aa6.46□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 H3BTX0 84 aa6.46□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CSN3P07498 182 aa6.46□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.46□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PSMB3P49720 205 aa6.46□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.46□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TCF24Q7RTU0 167 aa6.46□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF503Q96F45 646 aa6.46□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MDFIQ99750 246 aa6.46□□□□□ -1.38
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SAP30O75446 220 aa6.45□□□□□ -1.38
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GP9P14770 177 aa6.45□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PPT1P50897 306 aa6.45□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RIPPLY3P57055 190 aa6.45□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UBE2G2P60604 165 aa6.45□□□□□ -1.38
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GLMPQ8WWB7 406 aa6.45□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FXYD5Q96DB9 178 aa6.45□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C17orf77Q96MU5 243 aa6.45□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.45□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MLXQ9UH92 298 aa6.45□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.45□□□□□ -1.38
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD5P06127 495 aa6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGLC2P0DOY2 106 aa6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD33P20138 364 aa6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TFPI2P48307 235 aa6.44□□□□□ -1.38
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PAFAH1B2P68402 229 aa6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GUK1Q16774 197 aa6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CST9LP1Q5W188 147 aa6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MEOX2P50222 304 aa6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PSG9Q00887 426 aa6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SUN5Q8TC36 379 aa6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C16orf92Q96LL3 132 aa6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RARRES2Q99969 163 aa6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MANBALQ9NQG1 85 aa6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.42□□□□□ -1.38
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