RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528847.1

RPS3-211, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

TSL 5

Gene RPS3, Length 639 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-211ENST00000528847 LHFPL1Q86WI0 220 aa6.85□□□□□ -1.31
RPS3-211ENST00000528847 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.85□□□□□ -1.31
RPS3-211ENST00000528847 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.85□□□□□ -1.31
RPS3-211ENST00000528847 SVIPQ8NHG7 77 aa6.85□□□□□ -1.31
RPS3-211ENST00000528847 PPP1R14BQ96C90 147 aa6.85□□□□□ -1.31
RPS3-211ENST00000528847 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RPS3-211ENST00000528847 CACNG5Q9UF02 275 aa6.85□□□□□ -1.31
RPS3-211ENST00000528847 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.85□□□□□ -1.31
RPS3-211ENST00000528847 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.84□□□□□ -1.31
RPS3-211ENST00000528847 NXPH4O95158 308 aa6.84□□□□□ -1.31
RPS3-211ENST00000528847 MEOX2P50222 304 aa6.84□□□□□ -1.31
RPS3-211ENST00000528847 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.84□□□□□ -1.31
RPS3-211ENST00000528847 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.84□□□□□ -1.31
RPS3-211ENST00000528847 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.84□□□□□ -1.31
RPS3-211ENST00000528847 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RPS3-211ENST00000528847 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.84□□□□□ -1.31
RPS3-211ENST00000528847 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.84□□□□□ -1.31
RPS3-211ENST00000528847 SLC25A22Q9H936 323 aa6.84□□□□□ -1.31
RPS3-211ENST00000528847 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.84□□□□□ -1.31
RPS3-211ENST00000528847 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.83□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 ZNF98A6NK75 572 aa6.83□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 CDS2O95674 445 aa6.83□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 GALR1P47211 349 aa6.83□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 RHOBP62745 196 aa6.83□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.83□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.83□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 FAM219AQ8IW50 185 aa6.83□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.83□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.83□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 COPZ2Q9P299 210 aa6.83□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 OR5AC1P0C628 307 aa6.82□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 FGL1Q08830 312 aa6.82□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.82□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 NFE4Q86UQ8 179 aa6.82□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 NOXA1Q86UR1 476 aa6.82□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 ZNF738Q8NE65 137 aa6.82□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.81□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 ADAP1O75689 374 aa6.81□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 RLN2P04090 185 aa6.81□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 GABARAPL2P60520 117 aa6.81□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 Q6ZTI0 123 aa6.81□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 LGI3Q8N145 548 aa6.81□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.81□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.81□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.81□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.81□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.81□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 IL22RA2Q969J5 263 aa6.81□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 TRGV9Q99603 122 aa6.81□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 U3KQ87 197 aa6.81□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 H7BYZ3 331 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 TMEM127O75204 238 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 CD3DP04234 171 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 CDKN1BP46527 198 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 SLC35E1Q96K37 410 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 RBKSQ9H477 322 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 RNF213Q63HN8 5207 aa6.8□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 GABARAPH6UMI1 98 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 GABARAPO95166 117 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 FABP1P07148 127 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 ORM2P19652 201 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 CXCL3P19876 107 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 IZUMO2Q6UXV1 221 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 THAP8Q8NA92 274 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 TERB2Q8NHR7 220 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 DTD1Q8TEA8 209 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 PRR13Q9NZ81 148 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.79□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa6.78□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.78□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 SNURFLB1AK76 121 aa6.78□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 B3GALNT1O75752 331 aa6.78□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.78□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.78□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 PSG3Q16557 428 aa6.78□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.78□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.78□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 NAA60Q9H7X0 242 aa6.78□□□□□ -1.32
RPS3-211ENST00000528847 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms