RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 CCR6P51684 374 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 TMBIM6P55061 237 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 PIGPP57054 158 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 RAB11AP62491 216 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 RPL30P62888 115 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 WT1-ASQ06250 92 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM16LQ309B1 348 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 C2orf83Q53S99 150 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 SOHLH1Q5JUK2 328 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 LHFPL1Q86WI0 220 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 UBAC2Q8NBM4 344 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 OR4D5Q8NGN0 318 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 SMIM4Q8WVI0 70 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 MAFIPQ8WZ33 124 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM230Q96A57 120 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 YIPF6Q96EC8 236 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 SEC22AQ96IW7 307 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 RARRES2Q99969 163 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 C20orf24Q9BUV8 137 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 HINT2Q9BX68 163 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM222Q9H0R3 208 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 MLXQ9UH92 298 aa3.07□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 TRAV10A0A0B4J240 114 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 A0A0B4J2A0 478 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1B0GU03 582 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1B0GVY2 172 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 NAP1L6A6NFF2 107 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 FNDC10F2Z333 226 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 I3L2K1 104 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 CHEK1O14757 476 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 RGS5O15539 181 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 TNFSF12O43508 249 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 ADAP1O75689 374 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 RAB3DO95716 219 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 MT-CO2P00403 227 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 TRBV12-3P01733 135 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 CTSGP08311 255 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 CD7P09564 240 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 S100A5P33763 92 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 G6PCP35575 357 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 PSMB3P49720 205 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 SELENOTP62341 195 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 BSXQ3C1V8 233 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 C10orf55Q5SWW7 151 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 STEAP1BQ6NZ63 245 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 LYG2Q86SG7 212 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 LGI3Q8N145 548 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 DEFB125Q8N687 156 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 GVQW1Q8N7I0 195 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 CASTOR1Q8WTX7 329 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 C5orf30Q96GV9 206 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 SLC35E1Q96K37 410 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 RNF126Q9BV68 326 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 FUNDC2Q9BWH2 189 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 RNF167Q9H6Y7 350 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 NRN1Q9NPD7 142 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 COMMD3Q9UBI1 195 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 SHPKQ9UHJ6 478 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 RABAC1Q9UI14 185 aa3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP3.06□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 CENPXA8MT69 81 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 SNRPGP15A8MWD9 76 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 EPM2AB3EWF7 344 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 ISLRO14498 428 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 NXPH4O95158 308 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 PMP2P02689 132 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 PRH1P02810 166 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 APELAP0DMC3 54 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 CXCL2P19875 107 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 HLA-DMAP28067 261 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 OR10J1P30954 320 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 GALR1P47211 349 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 VBP1P61758 197 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 SMCO1Q147U7 214 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 OXA1LQ15070 435 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM128Q5BJH2 165 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 EBLN2Q6P2I7 272 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 TCF24Q7RTU0 167 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM256Q8N2U0 113 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 OR51S1Q8NGJ8 323 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 OR51G1Q8NGK1 321 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 MRGPRFQ96AM1 343 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 C20orf144Q9BQM9 153 aa3.05□□□□□ -1.92
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