RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510056.5

MATR3-215, Transcript of matrin 3, human

TSL 5 BASIC

Gene MATR3, Length 3,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-215	ENST00000510056	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	S100A13	Q99584	98 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056		K7EQG2	157 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	MSMB	P08118	114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	TAS2R30	P59541	319 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	METTL26	Q96S19	204 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	SPIN2A	Q99865	258 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056		C9JQL5	133 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	NAPSA	O96009	420 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	MUC21	Q5SSG8	566 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	LINC01619	G3V211	115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	ZNF728	P0DKX0	622 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	PPOX	P50336	477 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	PCBD1	P61457	104 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	MPV17L	Q2QL34	196 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	SSX8	Q7RTT4	187 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	OR4X1	Q8NH49	305 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	PDCD6	O75340	191 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	GAGE7	O76087	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	HOXA5	P20719	270 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	GAGE1	Q13065	139 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	GAGE4	Q13068	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	NMS	Q5H8A3	153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	DOK5	Q9P104	306 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056		M0R135	149 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	PHOX2A	O14813	284 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	RER1	O15258	196 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	NXPH4	O95158	308 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	HPRT1	P00492	218 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	OR10J4	P0C629	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	COL8A2	P25067	703 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	CD200	P41217	278 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	RAB2A	P61019	212 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	ARFRP1	Q13795	201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	PMVK	Q15126	192 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	KHDC3L	Q587J8	217 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	PNKD	Q8N490	385 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	ZNF799	Q96GE5	643 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	AK3	Q9UIJ7	227 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-215	ENST00000510056	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-215	ENST00000510056	IFNA17	P01571	189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-215	ENST00000510056	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-215	ENST00000510056	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-215	ENST00000510056	APLNR	P35414	380 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MATR3-215	ENST00000510056	RBP2	P50120	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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