RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 GGT3PA6NGU5 568 aa2.95□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 FABP5P3A8MUU1 101 aa2.95□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 NPYP01303 97 aa2.95□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 PAEPP09466 180 aa2.95□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 CXCL8P10145 99 aa2.95□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 GNGT1P63211 74 aa2.95□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 AKR1C1Q04828 323 aa2.95□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 OR8B8Q15620 311 aa2.95□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 FAM229BQ4G0N7 80 aa2.95□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 CROCCP2Q86T23 111 aa2.95□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 OR52R1Q8NGF1 315 aa2.95□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 SMCR5Q8TEV8 140 aa2.95□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 C1orf54Q8WWF1 131 aa2.95□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 TSC22D3Q99576 134 aa2.95□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 RTL8AQ9BWD3 113 aa2.95□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 OR8D2Q9GZM6 311 aa2.95□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 AICDAQ9GZX7 198 aa2.95□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa2.95□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 LTBP2Q14767 1821 aa2.95□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 CACNA1HO95180 2353 aa2.95□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 DMXL1Q9Y485 3027 aa2.95□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 MYO9BQ13459 2157 aa2.94□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa2.94□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa2.94□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 ZNF860A6NHJ4 632 aa2.94□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 C17orf98A8MV24 154 aa2.94□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 J3KT08 172 aa2.94□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 TAX1BP3O14907 124 aa2.94□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 CST8O60676 142 aa2.94□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 SOD1P00441 154 aa2.94□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 BPGMP07738 259 aa2.94□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa2.94□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 HLA-DMBP28068 263 aa2.94□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 CCR2P41597 374 aa2.94□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 FOXA1P55317 472 aa2.94□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 AGTRAPQ6RW13 159 aa2.94□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 ZNF767PQ75MW2 155 aa2.94□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 OR10P1Q8NGE3 313 aa2.94□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 OR8J3Q8NGG0 315 aa2.94□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 DCANP1Q8TF63 244 aa2.94□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 MCEEQ96PE7 176 aa2.94□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 TMEM126AQ9H061 195 aa2.94□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 TMEM133Q9H2Q1 129 aa2.94□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa2.94□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 ZNF407Q9C0G0 2248 aa2.94□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 MYH11P35749 1972 aa2.94□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 VPS13AQ96RL7 3174 aa2.94□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 MGAMO43451 1857 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 A0A0D9SEW6 157 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 H7BYZ3 331 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 CYB5BO43169 146 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 GAS8-AS1O95177 125 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 SHBGP04278 402 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 BCL2P10415 239 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 KDELR1P24390 212 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 S100A4P26447 101 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 PSMB8P28062 276 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 MIAQ16674 131 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 LINC01554Q52M75 96 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 SPANXN3Q5MJ09 141 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 LCE1FQ5T754 118 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 C2orf91Q6ZV80 131 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 Q8NAQ8 132 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 TERB2Q8NHR7 220 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 ISOC1Q96CN7 298 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 TEX37Q96LM6 180 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 PFDN5Q99471 154 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 SLC39A9Q9NUM3 307 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 ASF1BQ9NVP2 202 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 CKLFQ9UBR5 152 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 MED31Q9Y3C7 131 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 Q9Y3F1 56 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 HEY1Q9Y5J3 304 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 DENND4CQ5VZ89 1909 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 FAM186AA6NE01 2351 aa2.93□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 BRWD1Q9NSI6 2320 aa2.92□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 NAV2Q8IVL1 2488 aa2.92□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 SPTBN2O15020 2390 aa2.92□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 PARP14Q460N5 1801 aa2.92□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa2.92□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 A0A1B0GU33 70 aa2.92□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 C1orf196B1AJZ1 125 aa2.92□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 M0R378 163 aa2.92□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 TXNDC9O14530 226 aa2.92□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 IGHV3-7P01780 117 aa2.92□□□□□ -1.94
STRADB-210ENST00000498648 NFYBP25208 207 aa2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms