RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 LGALS9CQ6DKI2 356 aa2.58□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 OR10K2Q6IF99 312 aa2.58□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 ARRDC1Q8N5I2 433 aa2.58□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 CASTOR1Q8WTX7 329 aa2.58□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 GALNT14Q96FL9 552 aa2.58□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 TSC22D3Q99576 134 aa2.58□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 COMMD5Q9GZQ3 224 aa2.58□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 FKBP11Q9NYL4 201 aa2.58□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 COMMD9Q9P000 198 aa2.58□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 STARD9Q9P2P6 4700 aa2.58□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 SORL1Q92673 2214 aa2.58□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 TENM3Q9P273 2699 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 COL7A1Q02388 2944 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 TRAV2A0A0B4J234 112 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 TMEM213A2RRL7 107 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 C11orf94C9JXX5 98 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 TGOLN2O43493 480 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 LY6G6CO95867 125 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 TRBV12-3P01733 135 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 IFNA4P05014 189 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 CD7P09564 240 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 HSMCR30P0CW71 290 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 NQO2P16083 231 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 CTRB1P17538 263 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 HLA-GP17693 338 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 RAB3BP20337 219 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 LEPP41159 167 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 NMUP48645 174 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 PAFAH1B2P68402 229 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 PJVKQ0ZLH3 352 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 KCTD21Q4G0X4 260 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 C5orf47Q569G3 176 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 HACD4Q5VWC8 232 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 CTRB2Q6GPI1 263 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 PLET1Q6UQ28 207 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 LYG2Q86SG7 212 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 DEFB125Q8N687 156 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 GDPD1Q8N9F7 314 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 OR5B3Q8NH48 314 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 LINC00477Q96M19 166 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 TMEM56Q96MV1 263 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 MGLLQ99685 303 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 GINS3Q9BRX5 216 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 DUSP21Q9H596 190 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 HRASLSQ9HDD0 168 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 NDUFB11Q9NX14 153 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 ANXA10Q9UJ72 324 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 HYDINQ4G0P3 5121 aa2.57□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 LYSTQ99698 3801 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 IZUMO1RA6ND01 250 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 CORTO00230 105 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 AGPAT2O15120 278 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 SNAPC5O75971 98 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 ATG12O94817 140 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 GNAO1P09471 354 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 TRAPPC2P0DI81 140 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 TRAPPC2BP0DI82 140 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 RBMY1CP0DJD4 496 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 CRHBPP24387 322 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 GABARAPL2P60520 117 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 RPS25P62851 125 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 INSL4Q14641 139 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 TRIM16LQ309B1 348 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 LINC01620Q4KN68 170 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 HES5Q5TA89 166 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 LAIR2Q6ISS4 152 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 LPCAT3Q6P1A2 487 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 CLEC19AQ6UXS0 136 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 TMEM91Q6ZNR0 172 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 IDO2Q6ZQW0 420 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 LINC00336Q6ZUF6 198 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 CMTM1Q8IZ96 169 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 OR1L8Q8NGR8 309 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 ZNF502Q8TBZ5 544 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 GIMAP1Q8WWP7 306 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 TMEM203Q969S6 136 aa2.56□□□□□ -2
RBM39-241ENST00000496183 SEC22AQ96IW7 307 aa2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.7 ms