RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493967.1

PATJ-211, Transcript of PATJ, crumbs cell polarity complex component, humanhuman

TSL 2

Gene PATJ, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJ-211ENST00000493967 ISLRO14498 428 aa5.47□□□□□ -1.53
PATJ-211ENST00000493967 DEFB4AO15263 64 aa5.47□□□□□ -1.53
PATJ-211ENST00000493967 IGKV3-20P01619 116 aa5.47□□□□□ -1.53
PATJ-211ENST00000493967 SPP1P10451 314 aa5.47□□□□□ -1.53
PATJ-211ENST00000493967 HLA-DRB4P13762 266 aa5.47□□□□□ -1.53
PATJ-211ENST00000493967 ID1P41134 155 aa5.47□□□□□ -1.53
PATJ-211ENST00000493967 GALR1P47211 349 aa5.47□□□□□ -1.53
PATJ-211ENST00000493967 PSMB3P49720 205 aa5.47□□□□□ -1.53
PATJ-211ENST00000493967 SULT1A1P50225 295 aa5.47□□□□□ -1.53
PATJ-211ENST00000493967 PLP1P60201 277 aa5.47□□□□□ -1.53
PATJ-211ENST00000493967 RAP2BP61225 183 aa5.47□□□□□ -1.53
PATJ-211ENST00000493967 FGL1Q08830 312 aa5.47□□□□□ -1.53
PATJ-211ENST00000493967 PMS2P11Q13670 270 aa5.47□□□□□ -1.53
PATJ-211ENST00000493967 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa5.47□□□□□ -1.53
PATJ-211ENST00000493967 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PATJ-211ENST00000493967 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa5.47□□□□□ -1.53
PATJ-211ENST00000493967 PATE2Q6UY27 113 aa5.47□□□□□ -1.53
PATJ-211ENST00000493967 ZNF546Q86UE3 836 aa5.47□□□□□ -1.53
PATJ-211ENST00000493967 TMEM252Q8N6L7 170 aa5.47□□□□□ -1.53
PATJ-211ENST00000493967 C16orf92Q96LL3 132 aa5.47□□□□□ -1.53
PATJ-211ENST00000493967 C20orf173Q96LM9 149 aa5.47□□□□□ -1.53
PATJ-211ENST00000493967 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa5.47□□□□□ -1.53
PATJ-211ENST00000493967 ARV1Q9H2C2 271 aa5.47□□□□□ -1.53
PATJ-211ENST00000493967 UQCC1Q9NVA1 299 aa5.47□□□□□ -1.53
PATJ-211ENST00000493967 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa5.47□□□□□ -1.53
PATJ-211ENST00000493967 RYR2Q92736 4967 aa5.47□□□□□ -1.53
PATJ-211ENST00000493967 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.53
PATJ-211ENST00000493967 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa5.46□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 CXorf65A6NEN9 183 aa5.46□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 SSNA1O43805 119 aa5.46□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 S100A7P31151 101 aa5.46□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 CAMLGP49069 296 aa5.46□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 MEOX2P50222 304 aa5.46□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 H2BFSP57053 126 aa5.46□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 FXYD7P58549 80 aa5.46□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 VWC2Q2TAL6 325 aa5.46□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 LINC01559Q495D7 138 aa5.46□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 IGFL4Q6B9Z1 124 aa5.46□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 FOXI2Q6ZQN5 318 aa5.46□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 STX12Q86Y82 276 aa5.46□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 RNF182Q8N6D2 247 aa5.46□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa5.46□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 OR4B1Q8NGF8 309 aa5.46□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 NMES1Q9C002 83 aa5.46□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.46□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 XCL2Q9UBD3 114 aa5.46□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 WDR83OSQ9Y284 106 aa5.46□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa5.45□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 LCE6AA0A183 80 aa5.45□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 H0YIZ8 118 aa5.45□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 COX7A2P2O60397 106 aa5.45□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 RPL7P18124 248 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 S100A11P31949 105 aa5.45□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 HBG1P69891 147 aa5.45□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 HBG2P69892 147 aa5.45□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 NHLH2Q02577 135 aa5.45□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 BAXQ07812 192 aa5.45□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 RAB31Q13636 194 aa5.45□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 TMEM41BQ5BJD5 291 aa5.45□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.45□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 FAM78BQ5VT40 261 aa5.45□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 SAMD13Q5VXD3 122 aa5.45□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 MORN5Q5VZ52 161 aa5.45□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 MIC13Q5XKP0 118 aa5.45□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 LINC00305Q7Z4B0 112 aa5.45□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 TMEM37Q8WXS4 190 aa5.45□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 GPR82Q96P67 336 aa5.45□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 RPRMQ9NS64 109 aa5.45□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 X6R8D5 127 aa5.45□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 DNAH1Q9P2D7 4330 aa5.45□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.44□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 TRAV5A0A0B4J249 113 aa5.44□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa5.44□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 A0A0J9YX75 114 aa5.44□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 E5RGE8 158 aa5.44□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 RLN2P04090 185 aa5.44□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 RBMY1CP0DJD4 496 aa5.44□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 FGF7P21781 194 aa5.44□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 HLA-DMBP28068 263 aa5.44□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 CYCSP99999 105 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 OPCMLQ14982 345 aa5.44□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 ATP6V1FQ16864 119 aa5.44□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 C10orf113Q5VZT2 155 aa5.44□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 EBLN2Q6P2I7 272 aa5.44□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 Q6ZRG5 221 aa5.44□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 S100A7AQ86SG5 101 aa5.44□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 Q8NAQ8 132 aa5.44□□□□□ -1.54
PATJ-211ENST00000493967 OR5C1Q8NGR4 320 aa5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 217.3 ms