RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489318.1

C9orf3-220, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-220ENST00000489318 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa8.79□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 A0A087WW49 117 aa8.79□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 A0A1B0GUS0 222 aa8.79□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 C11orf94C9JXX5 98 aa8.79□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM250H0YL14 139 aa8.79□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 K7EMT4 169 aa8.79□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 LGALS9O00182 355 aa8.79□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 OR10J4P0C629 311 aa8.79□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 SFTA3P0C7M3 94 aa8.79□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 MYCNOSP40205 109 aa8.79□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 CCDC28AQ8IWP9 274 aa8.79□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 RXFP4Q8TDU9 374 aa8.79□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 GPR82Q96P67 336 aa8.79□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 OR5B12Q96R08 314 aa8.79□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 SEC11CQ9BY50 192 aa8.79□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.79□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 RNF114Q9Y508 228 aa8.79□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 A0A087X0K7 114 aa8.78□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 GGTLC3B5MD39 225 aa8.78□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 PDE6DO43924 150 aa8.78□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 NPPCP23582 126 aa8.78□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 ATP5G3P48201 142 aa8.78□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 UBE2G2P60604 165 aa8.78□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 FHL3Q13643 280 aa8.78□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 PDE6HQ13956 83 aa8.78□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 RPEL1Q2QD12 228 aa8.78□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 OR4F17Q8NGA8 305 aa8.78□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 C11orf52Q96A22 123 aa8.78□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 OR4F4Q96R69 305 aa8.78□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 TCEAL7Q9BRU2 100 aa8.78□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
C9orf3-220ENST00000489318 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 F6UZH7 168 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 H3BQ15 152 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF253O75346 499 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 NBEAP1P0C6P0 100 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 CD28P10747 220 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 FAM106AQ4KMX7 169 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 C18orf65Q6ZTR6 163 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 C1QL4Q86Z23 238 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 GLMPQ8WWB7 406 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF586Q9NXT0 402 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.76□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM213A2RRL7 107 aa8.76□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 LINC01619G3V211 115 aa8.76□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 NDUFB4O95168 129 aa8.76□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.76□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.76□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.76□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 C17orf77Q96MU5 243 aa8.76□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.76□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 NF1P21359 2839 aa8.76□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 A0A1W2PS18 150 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 F8W036 122 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 MEOX2P50222 304 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 CST9LP1Q5W188 147 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 OR11H1Q8NG94 326 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa8.75□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 SLC17A3O00476 420 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 GALR1P47211 349 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 DEFB136Q30KP8 78 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 SOHLH1Q5JUK2 328 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 C5orf17Q8NAS9 161 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 OR1N2Q8NGR9 330 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 GRAMD2BQ96HH9 432 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 ELOVL1Q9BW60 279 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 PARLQ9H300 379 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 Q9H3A6 140 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 OTORQ9NRC9 128 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 SMPXQ9UHP9 88 aa8.74□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF320A2RRD8 509 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 HAX1O00165 279 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 CHEK1O14757 476 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 BMI1P35226 326 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 KRTAP10-3P60369 221 aa8.73□□□□□ -1.01
C9orf3-220ENST00000489318 FOXL1Q12952 345 aa8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms