RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485612.5

SSR4-210, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene SSR4, Length 701 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-210ENST00000485612 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.52□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 GPR141Q7Z602 305 aa8.52□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 RNF182Q8N6D2 247 aa8.52□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.52□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 OR11H7Q8NGC8 314 aa8.52□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa8.52□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.52□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 RSG1Q9BU20 258 aa8.52□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 PTTG2Q9NZH5 202 aa8.52□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.51□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 ZNF98A6NK75 572 aa8.51□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 CNN1P51911 297 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 FCN2Q15485 313 aa8.51□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 TMED4Q7Z7H5 227 aa8.51□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 BAP18Q8IXM2 172 aa8.51□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 ZNF503Q96F45 646 aa8.51□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 TMEM208Q9BTX3 173 aa8.51□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 FABP1P07148 127 aa8.5□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 ANXA3P12429 323 aa8.5□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 AZU1P20160 251 aa8.5□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 GALR1P47211 349 aa8.5□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 MEOX2P50222 304 aa8.5□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 RAB11AP62491 216 aa8.5□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 SRPXP78539 464 aa8.5□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 SYT8Q8NBV8 401 aa8.5□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 SCGB3A2Q96PL1 93 aa8.5□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 SOSTQ9BQB4 213 aa8.5□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.49□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.49□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 H3BP45 60 aa8.49□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 WRBO00258 174 aa8.49□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 ORM2P19652 201 aa8.49□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 TNFSF8P32971 234 aa8.49□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 CCL18P55774 89 aa8.49□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 TRIM63Q969Q1 353 aa8.49□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.49□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 RABL2BQ9UNT1 228 aa8.49□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa8.48□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 FAM229AH3BQW9 127 aa8.48□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 INSP01308 110 aa8.48□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 DEFB130BP0DP73 79 aa8.48□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 DEFB130AP0DP74 79 aa8.48□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 VAMP1P23763 118 aa8.48□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 DLK1P80370 383 aa8.48□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 FGL1Q08830 312 aa8.48□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 GGNBP1Q5YKI7 109 aa8.48□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa8.48□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 BPIFCQ8NFQ6 507 aa8.48□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 OR1B1Q8NGR6 318 aa8.48□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 LYRM9A8MSI8 78 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 H3BRN7 92 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 SYNGR2O43760 224 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 CCNKO75909 580 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 HOXB5P09067 269 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 AKR1C1Q04828 323 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 PPP1R1AQ13522 171 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 TMEM128Q5BJH2 165 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 SPANXN5Q5MJ07 72 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 Q6ZSN1 163 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 LRTM2Q8N967 370 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 OR4D5Q8NGN0 318 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 RAB2BQ8WUD1 216 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 TMEM147Q9BVK8 224 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 Q9H8V8 135 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-210ENST00000485612 FABP12A6NFH5 140 aa8.46□□□□□ -1.06
SSR4-210ENST00000485612 F5H768 121 aa8.46□□□□□ -1.06
SSR4-210ENST00000485612 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.46□□□□□ -1.06
SSR4-210ENST00000485612 MED6O75586 246 aa8.46□□□□□ -1.06
SSR4-210ENST00000485612 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SSR4-210ENST00000485612 NUDT3O95989 172 aa8.46□□□□□ -1.06
SSR4-210ENST00000485612 CFDP00746 253 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SSR4-210ENST00000485612 SLC25A6P12236 298 aa8.46□□□□□ -1.06
SSR4-210ENST00000485612 ZNF738Q8NE65 137 aa8.46□□□□□ -1.06
SSR4-210ENST00000485612 SMCO3A2RU48 225 aa8.45□□□□□ -1.06
SSR4-210ENST00000485612 H3BMQ9 156 aa8.45□□□□□ -1.06
SSR4-210ENST00000485612 SFT2D2O95562 160 aa8.45□□□□□ -1.06
SSR4-210ENST00000485612 TSPOP30536 169 aa8.45□□□□□ -1.06
SSR4-210ENST00000485612 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SSR4-210ENST00000485612 TTC32Q5I0X7 151 aa8.45□□□□□ -1.06
SSR4-210ENST00000485612 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8.45□□□□□ -1.06
SSR4-210ENST00000485612 RNF141Q8WVD5 230 aa8.45□□□□□ -1.06
SSR4-210ENST00000485612 GPR82Q96P67 336 aa8.45□□□□□ -1.06
SSR4-210ENST00000485612 UHRF2Q96PU4 802 aa8.45□□□□□ -1.06
SSR4-210ENST00000485612 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SSR4-210ENST00000485612 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.45□□□□□ -1.06
SSR4-210ENST00000485612 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.45□□□□□ -1.06
SSR4-210ENST00000485612 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.44□□□□□ -1.06
SSR4-210ENST00000485612 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
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