RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 COX6CP09669 75 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 CACNG7P62955 275 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 C9orf139Q6ZV77 190 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 WDR86Q86TI4 376 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 OR5AN1Q8NGI8 311 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 FAM215AQ9Y5M1 114 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 OR11H12B2RN74 326 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 LCNL1Q6ZST4 164 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 ZNF414Q96IQ9 312 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 GTF3C1Q12789 2109 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 GCSAMLQ5JQS6 135 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 OR10W1Q8NGF6 305 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 DOCK10Q96BY6 2186 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 H3BRM9 83 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 CD7P09564 240 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 ERVK11-1P61568 191 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 MEIG1Q5JSS6 88 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 ANAPC13Q9BS18 74 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 PCDH15Q96QU1 1955 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 WNK2Q9Y3S1 2297 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 IGHV2-5P01817 119 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 PSMG4Q5JS54 123 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 ACTL10Q5JWF8 245 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 OR2K2Q8NGT1 345 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 LINC00527Q9UJ94 153 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 TRAV3A0A0B4J244 114 aa11.08□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 LYPD2Q6UXB3 125 aa11.08□□□□□ -0.63
NISCH-207ENST00000479054 A0A1B0GUT8 65 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 IGLV1-44P01699 117 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 OR10J3Q5JRS4 329 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 RFNGQ9Y644 331 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 A0A1W2PRE2 83 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 TMEM256Q8N2U0 113 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 IZUMO1RA6ND01 250 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 MST1LQ2TV78 715 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 TRGV9Q99603 122 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 SIGLEC9Q9Y336 463 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 CRPP02741 224 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 WT1P19544 449 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 CFHR2P36980 270 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 CKS1BP61024 79 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 LCN12Q6JVE5 192 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 PRADC1Q9BSG0 188 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 SPRY4Q9C004 299 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 C10orf55Q5SWW7 151 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 VGLL1Q99990 258 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 GGTLC1Q9BX51 225 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 PSG1P11464 419 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 DEFB113Q30KQ7 82 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 CFAP161Q6P656 301 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 TTC9CQ8N5M4 171 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 VCX2Q9H322 139 aa11.06□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 C9JQL5 133 aa11.06□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 LY6HO94772 140 aa11.06□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 SEC11AP67812 179 aa11.06□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 GAGE1Q13065 139 aa11.06□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 ZGRF1Q86YA3 2104 aa11.06□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 APOHP02749 345 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 ST20Q9HBF5 79 aa11.06□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 TYMSP04818 313 aa11.05□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 C10orf91Q5T1B1 145 aa11.05□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 GNB1LQ9BYB4 327 aa11.05□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa11.05□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 ATP5LO75964 103 aa11.05□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 ESDP10768 282 aa11.05□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 DKK4Q9UBT3 224 aa11.05□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 COX11Q9Y6N1 276 aa11.05□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa11.05□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 LINC01549A6NIU2 74 aa11.05□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 TEX36Q5VZQ5 186 aa11.05□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 ZNF562Q6V9R5 426 aa11.05□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 LYPD6Q86Y78 171 aa11.05□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 Q8NFD4 153 aa11.05□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 EPDR1Q9UM22 224 aa11.05□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 PGPEP1LA6NFU8 196 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 LINC01619G3V211 115 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 TSPAN13O95857 204 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 PRELID3AQ96N28 172 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 UTRNP46939 3433 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 STAG3L3P0CL85 134 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 ZNF415Q09FC8 603 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 A0A1B0GUS0 222 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 INSP01308 110 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 OCIAD2Q56VL3 154 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-207ENST00000479054 GTSF1LQ9H1H1 148 aa11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms