RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468599.1

CNOT10-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, humanhuman

TSL 5

Gene CNOT10, Length 811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT10-211ENST00000468599 SRD5A3Q9H8P0 318 aa8.38□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 HELTA6NFD8 242 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 A8MZ25 164 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 ARPC5O15511 151 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 CD5P06127 495 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF688P0C7X2 276 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 CD300CQ08708 224 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 RAB31Q13636 194 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 C1orf194Q5T5A4 169 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 NRN1Q9NPD7 142 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 COL7A1Q02388 2944 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.36□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 DEFB131AP59861 70 aa8.36□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 DEFB1P60022 68 aa8.36□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.36□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.36□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 ASCL2Q99929 193 aa8.36□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 B9D2Q9BPU9 175 aa8.36□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.36□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 AGRNO00468 2067 aa8.35□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 LCE2BO14633 110 aa8.35□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 IFNA5P01569 189 aa8.35□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 CXCL2P19875 107 aa8.35□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 PAFAH1B2P68402 229 aa8.35□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.35□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 TCTE3Q8IZS6 198 aa8.35□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.35□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 OR1L4Q8NGR5 311 aa8.35□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 C20orf173Q96LM9 149 aa8.35□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.35□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.35□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 RYR3Q15413 4870 aa8.35□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 A0A087X0K7 114 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 ATP6V0CP27449 155 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 GALR1P47211 349 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 PSMG4Q5JS54 123 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 Q6ZRG5 221 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 MIR17HGQ75NE6 70 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 PFDN5Q99471 154 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 MFFQ9GZY8 342 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.34□□□□□ -1.07
CNOT10-211ENST00000468599 KNCNA6PVL3 124 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 HMSDA8MTL9 139 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 C17orf112F2Z3M2 114 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 H3BQ15 152 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 H3BTX0 84 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 SLC17A3O00476 420 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 IGLC2P0DOY2 106 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 HLA-DMBP28068 263 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 RAB2AP61019 212 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF266Q14584 549 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF345Q14585 488 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 KCNRGQ8N5I3 272 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF709Q8N972 641 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 SCGB1C1Q8TD33 95 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 GPR82Q96P67 336 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 TUBA4BQ9H853 241 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 TENM3Q9P273 2699 aa8.33□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 PYYP10082 97 aa8.32□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 PSMB3P49720 205 aa8.32□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 HAGHQ16775 308 aa8.32□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 GDF5OSQ5U4N7 250 aa8.32□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 FAM78BQ5VT40 261 aa8.32□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 AKAP14Q86UN6 197 aa8.32□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 RNF182Q8N6D2 247 aa8.32□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 ZNF503Q96F45 646 aa8.32□□□□□ -1.08
CNOT10-211ENST00000468599 RETNQ9HD89 108 aa8.32□□□□□ -1.08
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