RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466636.1

SRPRB-202, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene SRPRB, Length 917 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-202ENST00000466636 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 BTN1A1Q13410 526 aa7.35□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 FOXE3Q13461 319 aa7.35□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF674Q2M3X9 581 aa7.35□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 S100A7AQ86SG5 101 aa7.35□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 OR4X2Q8NGF9 303 aa7.35□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 TVP23CQ96ET8 276 aa7.35□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 C20orf24Q9BUV8 137 aa7.35□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 ELOVL1Q9BW60 279 aa7.35□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.35□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.35□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 NAT8Q9UHE5 227 aa7.35□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 RABAC1Q9UI14 185 aa7.35□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 ITPR3Q14573 2671 aa7.34□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.34□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 ELANEP08246 267 aa7.34□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 SLC35B1P78383 322 aa7.34□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 SCGB2A2Q13296 93 aa7.34□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 RHEBQ15382 184 aa7.34□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.34□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 TEX38Q6PEX7 206 aa7.34□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 Q6ZSV7 163 aa7.34□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.34□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 RNF152Q8N8N0 203 aa7.34□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.34□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 TCEAL7Q9BRU2 100 aa7.34□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 DERL1Q9BUN8 251 aa7.34□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 U3KQE9 123 aa7.34□□□□□ -1.23
SRPRB-202ENST00000466636 ABCA1O95477 2261 aa7.33□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.33□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.33□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.33□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 H3BTX0 84 aa7.33□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 NDUFA4O00483 81 aa7.33□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 CRYBB3P26998 211 aa7.33□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 S100A7P31151 101 aa7.33□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 AKR1C3P42330 323 aa7.33□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 RANP62826 216 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 FAM209BQ5JX69 171 aa7.33□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.33□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 OR4F17Q8NGA8 305 aa7.33□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 BLNKQ8WV28 456 aa7.33□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.33□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 OTORQ9NRC9 128 aa7.33□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 RNF24Q9Y225 148 aa7.33□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 PGPA6NDG6 321 aa7.32□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 B4DEV8 164 aa7.32□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 C9JCJ5 164 aa7.32□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 BUB3O43684 328 aa7.32□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 FOSL1P15407 271 aa7.32□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 RPL7P18124 248 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 SRD5A1P18405 259 aa7.32□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 RPL15P61313 204 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 C1orf194Q5T5A4 169 aa7.32□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.32□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.32□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.32□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 C17orf77Q96MU5 243 aa7.32□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 METTL26Q96S19 204 aa7.32□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 Q9H3A6 140 aa7.32□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa7.32□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.32□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.32□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 A0A087WWC5 75 aa7.31□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 A0A087X0K7 114 aa7.31□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 SLC17A3O00476 420 aa7.31□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 PEX7O00628 323 aa7.31□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 GGCTO75223 188 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 APOHP02749 345 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 CD99P14209 185 aa7.31□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 HILS1P60008 231 aa7.31□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 GNG5P63218 68 aa7.31□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 PDE6HQ13956 83 aa7.31□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 ADIRFQ15847 76 aa7.31□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa7.31□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 LINC01551Q86U37 167 aa7.31□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.31□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.31□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 UBE2E2Q96LR5 201 aa7.31□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 OR5B12Q96R08 314 aa7.31□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.31□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 EPDR1Q9UM22 224 aa7.31□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 LY96Q9Y6Y9 160 aa7.31□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.31□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 CCDC168Q8NDH2 2452 aa7.3□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 HELTA6NFD8 242 aa7.3□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 PGPEP1LA6NFU8 196 aa7.3□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 TSPAN4O14817 238 aa7.3□□□□□ -1.24
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms