RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 MRGPRFQ96AM1 343 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 SLC25A22Q9H936 323 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 SSX5O60225 188 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 SPINK4O60575 86 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 ARL6IP5O75915 188 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 NXPH3O95157 252 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 TIRAPP58753 221 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 BSXQ3C1V8 233 aa8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 PITX3O75364 302 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 TOR2AQ5JU69 321 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 CCDC190Q86UF4 302 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 OR1B1Q8NGR6 318 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 VAX2Q9UIW0 290 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 IGKV1-39P01597 117 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 IGKV1D-39P04432 117 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 C14orf177Q52M58 125 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 STEAP1BQ6NZ63 245 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 NHLRC2Q8NBF2 726 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 RMI2Q96E14 147 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf3-211ENST00000463372 ZFP92A6NM28 416 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 SNRPGP15A8MWD9 76 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 J3KRW8 73 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 GPR31O00270 319 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 S100GP29377 79 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 GPR82Q96P67 336 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 KLF12Q9Y4X4 402 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 PHOX2AO14813 284 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 GYG2O15488 501 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 FABP1P07148 127 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 HSMCR30P0CW71 290 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 TAS2R20P59543 309 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF90Q03938 601 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 PRR4Q16378 134 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 DNAL1Q4LDG9 190 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 C2orf83Q53S99 150 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 NANOGP1Q8N7R0 232 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 C7orf33Q8WU49 177 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 DPH3Q96FX2 82 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 TCL1AP56279 114 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 HOGA1Q86XE5 327 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 OR4D5Q8NGN0 318 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 DIABLOQ9NR28 239 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 GGTLC3B5MD39 225 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 HRH1P35367 487 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 AKR1C2P52895 323 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 PHLDA2Q53GA4 152 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM91Q6ZNR0 172 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 ARRDC1Q8N5I2 433 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 OR5AP2Q8NGF4 316 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 IFITM5A6NNB3 132 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 TAAR5O14804 337 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 SCGNO76038 276 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 SFTA3P0C7M3 94 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 CXCL3P19876 107 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 TBC1D26Q86UD7 250 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 EHFQ9NZC4 300 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 PDCD5O14737 125 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 C10orf67Q8IYJ2 551 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 ATG12O94817 140 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 S100A7P31151 101 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 LEPP41159 167 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 DHRS11Q6UWP2 260 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-211ENST00000463372 NOXA1Q86UR1 476 aa8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms