RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 SORL1Q92673 2214 aa7.32□□□□□ -1.24
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DDX39B-215ENST00000462256 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 AGMATQ9BSE5 352 aa7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 NDUFB8O95169 186 aa7.32□□□□□ -1.24
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DDX39B-215ENST00000462256 CGB7P0DN87 165 aa7.32□□□□□ -1.24
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DDX39B-215ENST00000462256 HSPB9Q9BQS6 159 aa7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 ITPR2Q14571 2701 aa7.32□□□□□ -1.24
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DDX39B-215ENST00000462256 RRN3P1Q2M238 152 aa7.31□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF429Q86V71 674 aa7.31□□□□□ -1.24
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DDX39B-215ENST00000462256 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
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DDX39B-215ENST00000462256 COL12A1Q99715 3063 aa7.31□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM89A2RUT3 159 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 ELOBQ15370 118 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 LCN15Q6UWW0 184 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 PPP5D1E7EU14 171 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 MPDU1O75352 247 aa7.3□□□□□ -1.24
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DDX39B-215ENST00000462256 OR52E5Q8NH55 327 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 GP9P14770 177 aa7.3□□□□□ -1.24
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DDX39B-215ENST00000462256 CGB1A6NKQ9 187 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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DDX39B-215ENST00000462256 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 SLURP1P55000 103 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 RNF125Q96EQ8 232 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 NAGKQ9UJ70 344 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.3□□□□□ -1.24
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DDX39B-215ENST00000462256 TNCP24821 2201 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 ATMQ13315 3056 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 PGPEP1LA6NFU8 196 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 AMY1AP04745 511 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 DLK1P80370 383 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM252Q8N6L7 170 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 KLK15Q9H2R5 256 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 ZFP30Q9Y2G7 519 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.29□□□□□ -1.24
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DDX39B-215ENST00000462256 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF702PQ9H963 129 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF688P0C7X2 276 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 PAX2Q02962 417 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 IGHG4P01861 327 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 PSMB3P49720 205 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 EMP1P54849 157 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF747Q9BV97 191 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 C2orf83Q53S99 150 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 PSMG4Q5JS54 123 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF479Q96JC4 524 aa7.28□□□□□ -1.24
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