RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRCDQ00LT1 54 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RUNX1Q01196 453 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DEFA6Q01524 100 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NECAP1Q8NC96 275 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR5B3Q8NH48 314 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TSC22D3Q99576 134 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 JPT2Q9H910 190 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C9orf170A2RU37 121 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM223BA6NKX1 122 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SOCS3O14543 225 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADAP1O75689 374 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATG12O94817 140 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR4E1P0C645 316 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR8U8P0C7N1 319 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SYNJ2BPP57105 145 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP10-11P60412 298 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DHRS2Q13268 280 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NMSQ5H8A3 153 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMUB2Q71RG4 321 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LGI3Q8N145 548 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 USMG5Q96IX5 58 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TGP01266 2768 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A0B4J2A0 478 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR2T8A6NH00 312 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 K7EIM0 57 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OVOL1O14753 267 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATP5LO75964 103 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BRI3O95415 125 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DHFRP00374 187 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TCRBP04435 133 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IAPPP10997 89 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPNP16150 400 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC6A1P30531 599 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ASAH1Q13510 395 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMCO1Q147U7 214 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LYG2Q86SG7 212 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF429Q86V71 674 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MTURNQ8N3F0 131 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR1S1Q8NH92 325 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IL22RA2Q969J5 263 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RBKSQ9H477 322 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.23□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MT-CO2P00403 227 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CFC1BP0CG36 223 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CFC1P0CG37 223 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 STAG3L3P0CL85 134 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CT45A10P0DMU9 189 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLP1P60201 277 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPCS3P61009 180 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPEL1Q2QD12 228 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q56UQ5 140 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR1P1Q8NH06 330 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ENKURQ8TC29 256 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CACNG8Q8WXS5 425 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ENY2Q9NPA8 101 aa6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 I3L2K1 104 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SNCAP37840 140 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TNFRSF9Q07011 255 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IL34Q6ZMJ4 242 aa6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms