RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 AJUBAQ96IF1 538 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 MED12LQ86YW9 2145 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 FAM90A18PA6NE21 464 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 FAM90A16PA6NEW6 464 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 F8VRH5 84 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 ZNHIT1O43257 154 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 Q6ZT83 130 aa4.51□□□□□ -1.69
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PTPRC-209ENST00000442510 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 RNF114Q9Y508 228 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 CRYGDP07320 174 aa4.51□□□□□ -1.69
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PTPRC-209ENST00000442510 UBE2E1P51965 193 aa4.51□□□□□ -1.69
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PTPRC-209ENST00000442510 LRP6O75581 1613 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 POLEQ07864 2286 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 A0A0A6YYD5 115 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 BGLAPP02818 100 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRC-209ENST00000442510 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
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PTPRC-209ENST00000442510 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRC-209ENST00000442510 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 A8MZ25 164 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRC-209ENST00000442510 SDIM1Q6ZPB5 146 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 Q8IYB0 196 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRC-209ENST00000442510 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRC-209ENST00000442510 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 M0QZQ0 153 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 PRSS12P56730 875 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 C11orf52Q96A22 123 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 ELSPBP1Q96BH3 223 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 TIAM2Q8IVF5 1701 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PRU2 124 aa4.49□□□□□ -1.69
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PTPRC-209ENST00000442510 Q6ZNB5 142 aa4.49□□□□□ -1.69
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PTPRC-209ENST00000442510 NFE4Q86UQ8 179 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
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PTPRC-209ENST00000442510 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa4.49□□□□□ -1.69
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PTPRC-209ENST00000442510 IGKV1-33P01594 117 aa4.49□□□□□ -1.69
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PTPRC-209ENST00000442510 WISP1O95388 367 aa4.48□□□□□ -1.69
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PTPRC-209ENST00000442510 PLAC8L1A1L4L8 177 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM202A6NGA9 273 aa4.48□□□□□ -1.69
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PTPRC-209ENST00000442510 TREML4Q6UXN2 200 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 VN1R4Q7Z5H5 301 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 DOCK7Q96N67 2140 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 ANAPC10Q9UM13 185 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 PLCE1Q9P212 2302 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-209ENST00000442510 A0A087WV48 116 aa4.48□□□□□ -1.69
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