RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 J3QT63 122 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV3-13P01766 116 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM106CPP0CH98 169 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 DUTP33316 252 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 CSN1S1P47710 185 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 UTF1Q5T230 341 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 GCSAMQ8N6F7 178 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.77□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 FXYD7P58549 80 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 FCN3O75636 299 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 CD40P25942 277 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 MLANAQ16655 118 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR86Q86TI4 376 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF329Q86UD4 541 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 JPT1Q9UK76 154 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.76□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 MT-ATP8P03928 68 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 CT45A6P0DMU7 189 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 CT45A5P0DMU8 189 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 CT45A7P0DMV0 189 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 OR9G1Q8NH87 305 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 ENY2Q9NPA8 101 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 OR11H12B2RN74 326 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 PROP1O75360 226 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 P01737 135 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 SP1P08047 785 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 SYT8Q8NBV8 401 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 OR11H1Q8NG94 326 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 OR11H2Q8NH07 326 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 LTAP01374 205 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 OR1C1Q15619 314 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 C3AR1Q16581 482 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 RAXQ9Y2V3 346 aa6.75□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 AGRNO00468 2067 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 B5MCH6 92 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 CCL4P13236 92 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 BAALCQ8WXS3 180 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1B0GWB2 263 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 GRPP07492 148 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 CCL11P51671 97 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 GAGE13Q4V321 117 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 GGNQ86UU5 652 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 DDB2Q92466 427 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 C16orf92Q96LL3 132 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A096LNJ9 63 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 WNT9BO14905 357 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 MOSP00540 346 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 PLAUP00749 431 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 OR13A1Q8NGR1 328 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 COQ2Q96H96 371 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 PAXXQ9BUH6 204 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 CDIP1Q9H305 208 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 ERG28Q9UKR5 140 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 SVILO95425 2214 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 E9PLD3 99 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 APOMO95445 188 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 FOLR3P41439 243 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF146Q15072 292 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR82Q96P67 336 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-203ENST00000439720 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.4 ms