RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1B0GWB2 263 aa10.96□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1W2PPI3 338 aa10.96□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 GNLYP22749 145 aa10.96□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 GATA4P43694 442 aa10.96□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 CD69Q07108 199 aa10.96□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 STPG4Q8N801 248 aa10.96□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 OR5AL1P0C617 328 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 GCSHP23434 173 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 NRN1Q9NPD7 142 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 TYMSP04818 313 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 LY6EQ16553 131 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 PRNTQ86SH4 94 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM14BQ9NUH8 114 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM167BQ9NRX6 74 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 OR2T8A6NH00 312 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 CHEK1O14757 476 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 MFAP2P55001 183 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 IGFL4Q6B9Z1 124 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 MMD2Q8IY49 270 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM19A2Q8N3H0 131 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM191AQ9H0A3 160 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 MSRB2Q9Y3D2 182 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 OR2J3O76001 311 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 CFHR2P36980 270 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 PPP1R27Q86WC6 154 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 ANAPC16Q96DE5 110 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 PERPQ96FX8 193 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 YAE1D1Q9NRH1 226 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 HYPMO75409 117 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM256Q8N2U0 113 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 JKAMPQ9P055 326 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 CA7P43166 264 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 MPV17L2Q567V2 206 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 TEX29Q8N6K0 151 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 IL4P05112 153 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 NMUP48645 174 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM219Q86XT9 240 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 ARL17AQ8IVW1 177 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 OR2K2Q8NGT1 345 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 DDB2Q92466 427 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 UFC1Q9Y3C8 167 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 C7orf71A4D174 169 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 P0C879 139 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 MTORP42345 2549 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 SFTA2Q6UW10 78 aa10.92□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa10.91□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A087WWC5 75 aa10.91□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1B0GW64 132 aa10.91□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 AMY1AP04745 511 aa10.91□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM155Q4W5P6 130 aa10.91□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa10.91□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 TEX36Q5VZQ5 186 aa10.91□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 BRD3OSQ6XYD6 125 aa10.91□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 SPINK8P0C7L1 97 aa10.9□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa10.9□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 OR52E5Q8NH55 327 aa10.9□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 DPM3Q9P2X0 92 aa10.9□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 UCNP55089 124 aa10.9□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 OR10AG1Q8NH19 301 aa10.9□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 PTPRBP23467 1997 aa10.9□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 CGB3P0DN86 165 aa10.9□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 CGB7P0DN87 165 aa10.9□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 HIGD1AQ9Y241 93 aa10.9□□□□□ -0.66
RABGEF1-210ENST00000437078 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa10.9□□□□□ -0.67
RABGEF1-210ENST00000437078 NBEAP1P0C6P0 100 aa10.9□□□□□ -0.67
RABGEF1-210ENST00000437078 ADMP35318 185 aa10.9□□□□□ -0.67
RABGEF1-210ENST00000437078 TCF24Q7RTU0 167 aa10.9□□□□□ -0.67
RABGEF1-210ENST00000437078 PGLYRP4Q96LB8 373 aa10.9□□□□□ -0.67
RABGEF1-210ENST00000437078 C2CD3Q4AC94 2353 aa10.89□□□□□ -0.67
RABGEF1-210ENST00000437078 GGTLC3B5MD39 225 aa10.89□□□□□ -0.67
RABGEF1-210ENST00000437078 SERF1AO75920 110 aa10.89□□□□□ -0.67
RABGEF1-210ENST00000437078 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa10.89□□□□□ -0.67
RABGEF1-210ENST00000437078 FCN3O75636 299 aa10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms