RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 OR10X1Q8NGY0 326 aa12.33□□□□□ -0.43
SFRP4-201ENST00000436072 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa12.33□□□□□ -0.43
SFRP4-201ENST00000436072 CSTL1Q9H114 145 aa12.33□□□□□ -0.43
SFRP4-201ENST00000436072 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa12.33□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa12.33□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 A0A1W2PPI3 338 aa12.33□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 PRSS57Q6UWY2 283 aa12.33□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 WFDC3Q8IUB2 231 aa12.33□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 H3BUT2 72 aa12.33□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 TM4SF20Q53R12 229 aa12.33□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 HSPB8Q9UJY1 196 aa12.33□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa12.32□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 LTAP01374 205 aa12.32□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 CFHR2P36980 270 aa12.32□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 LYZP61626 148 aa12.32□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM97Q5BJF2 176 aa12.32□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 KLF12Q9Y4X4 402 aa12.32□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 K7ERU9 68 aa12.32□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 JMJD8Q96S16 334 aa12.32□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 RAB9BQ9NP90 201 aa12.32□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 AP5S1Q9NUS5 200 aa12.32□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 IGHV1-46P01743 117 aa12.31□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 IGLC1P0CG04 106 aa12.31□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP12.31□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 Q6ZS92 163 aa12.31□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 C5orf17Q8NAS9 161 aa12.31□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 C17orf77Q96MU5 243 aa12.31□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 AP1S3Q96PC3 154 aa12.31□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 COX8AP10176 69 aa12.31□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 FA2HQ7L5A8 372 aa12.31□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 NDFIP1Q9BT67 221 aa12.31□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 CNTFRP26992 372 aa12.3□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 NHLH1Q02575 133 aa12.3□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF788Q6ZQV5 615 aa12.3□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa12.3□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 ABHD17AQ96GS6 310 aa12.3□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 FMC1Q96HJ9 113 aa12.3□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 C1RLQ9NZP8 487 aa12.3□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 RABAC1Q9UI14 185 aa12.3□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 FAM71F2Q6NXP2 309 aa12.3□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF747Q9BV97 191 aa12.3□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 THYN1Q9P016 225 aa12.3□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 CHD8Q9HCK8 2581 aa12.3□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 GP9P14770 177 aa12.3□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 C1orf185Q5T7R7 199 aa12.3□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 LINC01545Q5VT33 79 aa12.3□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 IGF2-ASQ6U949 168 aa12.29□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 Q86TA4 180 aa12.29□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 THAP8Q8NA92 274 aa12.29□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa12.29□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 OR4C13Q8NGP0 309 aa12.29□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 FOXC1Q12948 553 aa12.29□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 IGFL3Q6UXB1 125 aa12.29□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 OR5AN1Q8NGI8 311 aa12.29□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa12.29□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 MS4A6AQ9H2W1 248 aa12.29□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 A0A1B0GUT8 65 aa12.28□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF785A8K8V0 405 aa12.28□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 FCN3O75636 299 aa12.28□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM200BQ69YZ2 307 aa12.28□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 FAM222BQ8WU58 562 aa12.28□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 ABCA4P78363 2273 aa12.28□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 GOSR1O95249 250 aa12.27□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 IGLV2-23P01705 113 aa12.27□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 TNFRSF1AP19438 455 aa12.27□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 GLRXP35754 106 aa12.27□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 CACNG7P62955 275 aa12.27□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 TIMM23BQ5SRD1 257 aa12.27□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 STXBP6Q8NFX7 210 aa12.27□□□□□ -0.44
SFRP4-201ENST00000436072 NCOR2Q9Y618 2525 aa12.27□□□□□ -0.45
SFRP4-201ENST00000436072 RBP4P02753 201 aa12.27□□□□□ -0.45
SFRP4-201ENST00000436072 ASCL5Q7RTU5 278 aa12.27□□□□□ -0.45
SFRP4-201ENST00000436072 PIP4P2Q8N4L2 257 aa12.27□□□□□ -0.45
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF492Q9P255 531 aa12.27□□□□□ -0.45
SFRP4-201ENST00000436072 DCHS2Q6V1P9 2916 aa12.27□□□□□ -0.45
SFRP4-201ENST00000436072 HAX1O00165 279 aa12.27□□□□□ -0.45
SFRP4-201ENST00000436072 NMUP48645 174 aa12.27□□□□□ -0.45
SFRP4-201ENST00000436072 S4R3C0 116 aa12.27□□□□□ -0.45
SFRP4-201ENST00000436072 COL6A6A6NMZ7 2263 aa12.26□□□□□ -0.45
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM213A2RRL7 107 aa12.26□□□□□ -0.45
SFRP4-201ENST00000436072 SMKR1H3BMG3 65 aa12.26□□□□□ -0.45
SFRP4-201ENST00000436072 KIR3DS1Q14943 382 aa12.26□□□□□ -0.45
SFRP4-201ENST00000436072 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM238C9JI98 176 aa12.26□□□□□ -0.45
SFRP4-201ENST00000436072 IGLV2-11P01706 119 aa12.26□□□□□ -0.45
SFRP4-201ENST00000436072 CT83Q5H943 113 aa12.26□□□□□ -0.45
SFRP4-201ENST00000436072 LYPD2Q6UXB3 125 aa12.26□□□□□ -0.45
SFRP4-201ENST00000436072 OR10AG1Q8NH19 301 aa12.26□□□□□ -0.45
SFRP4-201ENST00000436072 LINC00312Q9Y6C7 94 aa12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms