RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429581.2

PTPRD-AS2-201, Transcript of PTPRD antisense RNA 2 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD-AS2, Length 2,838 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM106CPP0CH98 169 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UBE2E1P51965 193 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGFL4Q6B9Z1 124 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM136Q6ZRR5 245 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CMTM2Q8TAZ6 248 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM18Q96B42 140 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MS4A10Q96PG2 267 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CHRDL1Q9BU40 450 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 VWC2LB2RUY7 222 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OVOL3O00110 214 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ATP6V0E1O15342 81 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MFAP4P55083 255 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BAGE3Q86Y29 109 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NUP35Q8NFH5 326 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GPR82Q96P67 336 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NEU1Q99519 415 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C7orf69Q9H7B7 122 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FBXL7Q9UJT9 491 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HIGD1CA8MV81 97 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 AMY1AP04745 511 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCL19Q99731 98 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FBN2P35556 2912 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NPIPB5A8MRT5 1133 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 H3BRN7 92 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TOMM40O96008 361 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLAQ13239 276 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GNB4Q9HAV0 340 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRAV40A0A0B4J280 105 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NPFFO15130 113 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HLA-DRB1P01911 266 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SRIP30626 198 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GPR183P32249 361 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GDF5OSQ5U4N7 250 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TTC9CQ8N5M4 171 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRBV19A0A075B6N1 114 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SSTP61278 116 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EBI3Q14213 229 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR4F17Q8NGA8 305 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM68Q96MH6 324 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RCHY1Q96PM5 261 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C15orf32Q32M92 178 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MBD6Q96DN6 1003 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MLST8Q9BVC4 326 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GNB1LQ9BYB4 327 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KLF12Q9Y4X4 402 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IZUMO1RA6ND01 250 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BMPR1BO00238 502 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CTSGP08311 255 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ATP5J2P56134 94 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RPL19P84098 196 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IQCJQ1A5X6 159 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OTORQ9NRC9 128 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OOSP1A8MZH6 123 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SCGB1D1O95968 90 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LTAP01374 205 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGLV2-11P01706 119 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGLC2P0DOY2 106 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BRS3P32247 399 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GRAMD2BQ96HH9 432 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LY6EQ16553 131 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 Q86TA4 180 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR2D3Q8NGH3 330 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 THYN1Q9P016 225 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 P01737 135 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HLA-DMBP28068 263 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RHOGP84095 191 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GTSF1Q8WW33 167 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FMC1Q96HJ9 113 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF414Q96IQ9 312 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C1RLQ9NZP8 487 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM14CQ9P0S9 112 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TLN2Q9Y4G6 2542 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF253O75346 499 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CLEC3BP05452 202 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM231DQ6ZW35 169 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TSKUQ8WUA8 353 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SAMD10Q9BYL1 202 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms