RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 NCR2O95944 276 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 PSG1P11464 419 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 CSPG4Q6UVK1 2322 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 LAGE3Q14657 143 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 GTSCR1Q86UQ5 136 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 CYTL1Q9NRR1 136 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 CRIM1Q9NZV1 1036 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 DOCK11Q5JSL3 2073 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 S100A7L2Q5SY68 101 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM256Q8N2U0 113 aa9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 A6NNC1 897 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 D6R8Y8 96 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 GAS1P54826 345 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF876PQ49A33 203 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 NMSQ5H8A3 153 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 LCN12Q6JVE5 192 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 RASL11AQ6T310 242 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 TCRAP04437 139 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 TDGF1P3P51864 188 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 FGFBP3Q8TAT2 258 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1B0GW64 132 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1B0GWJ7 208 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 IGHV1-46P01743 117 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 SELLP14151 372 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 GUSBP1Q15486 140 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 PYY3Q5JQD4 70 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00527Q9UJ94 153 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 SELENOKQ9Y6D0 94 aa9.05□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 PSPNO60542 156 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 WNT2P09544 360 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 PTPN13Q12923 2485 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 PAX4O43316 350 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 C3orf79P0CE67 100 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 C15orf32Q32M92 178 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 SCRT1Q9BWW7 348 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 CST9LQ9H4G1 147 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 MPV17L2Q567V2 206 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 RPRMLQ8N4K4 120 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 IGKV1-5P01602 117 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 THBDP07204 575 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 MST1P26927 711 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 GATD1Q8NB37 220 aa9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 VPS13AQ96RL7 3174 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 SRD5A1P18405 259 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 PRTN3P24158 256 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 OCIAD2Q56VL3 154 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 WDFY4Q6ZS81 3184 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF138P52744 262 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAV41A0A0B4J266 112 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 GTF3C1Q12789 2109 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 DTX2Q86UW9 622 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAV40A0A0B4J280 105 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 WFDC12Q8WWY7 111 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 LY96Q9Y6Y9 160 aa9.03□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 FRYLO94915 3013 aa9.02□□□□□ -0.96
EFTUD2-202ENST00000426333 RPL15P61313 204 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-202ENST00000426333 HGFACQ04756 655 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-202ENST00000426333 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-202ENST00000426333 TRGV9Q99603 122 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-202ENST00000426333 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-202ENST00000426333 hDV102S1A0JD36 115 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-202ENST00000426333 EFNA2O43921 213 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-202ENST00000426333 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-202ENST00000426333 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-202ENST00000426333 LTBRP36941 435 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-202ENST00000426333 C3orf36Q3SXR2 165 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-202ENST00000426333 C9orf139Q6ZV77 190 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A087X0K7 114 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF688P0C7X2 276 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-202ENST00000426333 C11orf44Q8N8P7 122 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-202ENST00000426333 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-202ENST00000426333 MGST2Q99735 147 aa9.02□□□□□ -0.97
EFTUD2-202ENST00000426333 E9PLN8 166 aa9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms