RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 PEX7O00628 323 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 GNG7O60262 68 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 PYYP10082 97 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 GP9P14770 177 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 AKR1D1P51857 326 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 LYZP61626 148 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM183BQ1AE95 376 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 CENPWQ5EE01 88 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 ASPHD1Q5U4P2 390 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 JMJD8Q96S16 334 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 OTORQ9NRC9 128 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 IL36BQ9NZH7 164 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 EPDR1Q9UM22 224 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 KLF12Q9Y4X4 402 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 TNCP24821 2201 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM89A2RUT3 159 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 B4DSR2 109 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 PHOX2AO14813 284 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 HIST1H2BKO60814 126 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 HIST1H2BJP06899 126 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 HIST1H2BOP23527 126 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 HIST1H2BBP33778 126 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 HIST1H2BDP58876 126 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 ERVFC1-1P60608 527 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 HIST1H2BCP62807 126 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 C19orf35Q6ZS72 473 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 FAM231DQ6ZW35 169 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 TEX29Q8N6K0 151 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF491Q8N8L2 437 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 NECAP1Q8NC96 275 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 RNF125Q96EQ8 232 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 PITPNC1Q9UKF7 332 aa7.86□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa7.85□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa7.85□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 PGPA6NDG6 321 aa7.85□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 PGPEP1LA6NFU8 196 aa7.85□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 H3BRN7 92 aa7.85□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 K7EN84 100 aa7.85□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 M0QZK8 103 aa7.85□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 MSMBP08118 114 aa7.85□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 TRGC1P0CF51 173 aa7.85□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 RAB9AP51151 201 aa7.85□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 UBE2G1P62253 170 aa7.85□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 RANP62826 216 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 NDPQ00604 133 aa7.85□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 PDE6HQ13956 83 aa7.85□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 RPEL1Q2QD12 228 aa7.85□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 Q56UQ5 140 aa7.85□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 ACTL10Q5JWF8 245 aa7.85□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.85□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.85□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 BAGE2Q86Y30 109 aa7.85□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 OR4F17Q8NGA8 305 aa7.85□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 FRZBQ92765 325 aa7.85□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 FMC1Q96HJ9 113 aa7.85□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 ATG101Q9BSB4 218 aa7.85□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.85□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 A0A0U1RQK1 487 aa7.84□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF320A2RRD8 509 aa7.84□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 J3QLI3 93 aa7.84□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 NDUFB8O95169 186 aa7.84□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 BRI3O95415 125 aa7.84□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 IGLV2-8P01709 118 aa7.84□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 IL4P05112 153 aa7.84□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 SMIM6P0DI80 62 aa7.84□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 NDUFA6P56556 154 aa7.84□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 PRR31Q5SQ13 230 aa7.84□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa7.84□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.84□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 GPR82Q96P67 336 aa7.84□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.84□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 V9GYV3 84 aa7.84□□□□□ -1.15
POLR1A-204ENST00000424089 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.83□□□□□ -1.16
POLR1A-204ENST00000424089 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7.83□□□□□ -1.16
POLR1A-204ENST00000424089 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa7.83□□□□□ -1.16
POLR1A-204ENST00000424089 K7EQM0 130 aa7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 123.6 ms