RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421202.5

CCDC18-AS1-205, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC18-AS1, Length 2,973 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 LY6LH3BQJ8 138 aa4.87□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CA2P00918 260 aa4.87□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PFN2P35080 140 aa4.87□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FOXI1Q12951 378 aa4.87□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZNF880Q6PDB4 577 aa4.87□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SGPP2Q8IWX5 399 aa4.87□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MSRB3Q8IXL7 192 aa4.87□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NUP37Q8NFH4 326 aa4.87□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MAP6D1Q9H9H5 199 aa4.87□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.87□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SLC25A15Q9Y619 301 aa4.87□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SELENOKQ9Y6D0 94 aa4.87□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 F8P00451 2351 aa4.87□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PLCE1Q9P212 2302 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 hDV102S1A0JD36 115 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 M0R1B8 84 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NDUFB4O95168 129 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CRYBB3P26998 211 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MPV17L2Q567V2 206 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 DPPA3Q6W0C5 159 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 IMMP2LQ96T52 175 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 AKAP9Q99996 3911 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MUC21A0A140T8X8 626 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 OVOL1O14753 267 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 IGLV1-44P01699 117 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 EDNRAP25101 427 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NMUP48645 174 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RND3P61587 244 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PPP1CBP62140 327 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CEACAM16Q2WEN9 425 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MUC21Q5SSG8 566 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 C10orf111Q8N326 155 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 C18orf12Q96KH6 178 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TMEM147Q9BVK8 224 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GNB1LQ9BYB4 327 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 BANF2Q9H503 90 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 C21orf62Q9NYP8 219 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RNF7Q9UBF6 113 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ALPK2Q86TB3 2170 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 A6NDN8 102 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 OOSP1A8MZH6 123 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 UMAD1C9J7I0 102 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TAS2R46P59540 309 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ADIRFQ15847 76 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 C12orf73Q69YU5 71 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 C11orf71Q6IPW1 123 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CEACAM19Q7Z692 300 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ODF3L1Q8IXM7 274 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 EMC6Q9BV81 110 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NRN1Q9NPD7 142 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RPRMQ9NS64 109 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZNF727A8MUV8 499 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SLC25A16P16260 332 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 IGHV1-2P23083 117 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 HMGA2P52926 109 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 HES1Q14469 280 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 C1orf140Q5VVS0 124 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZIC4Q8N9L1 334 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SPATA3Q8NHX4 192 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CCL19Q99731 98 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CHST6Q9GZX3 395 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ABRACLQ9P1F3 81 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 WASHC3Q9Y3C0 194 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 HIVEP1P15822 2718 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 AQP1P29972 269 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 BRWD1-AS2P59051 145 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TAS2R19P59542 299 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GAGE2BQ13066 116 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZNF718Q3SXZ3 478 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GAGE2EQ4V326 116 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 UBE2NLQ5JXB2 153 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SLC35E4Q6ICL7 350 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 OR10G2Q8NGC3 310 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GRIFINA4D1Z8 144 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SHISA9B4DS77 424 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GABARAPH6UMI1 98 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SEC11BP0C7V7 166 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 LINC00310P59036 64 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 Q0VG73 95 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FAM201AQ5SY85 155 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ST20Q9HBF5 79 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 VPS13CQ709C8 3753 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TRAV5A0A0B4J249 113 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.5 ms