RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 DLX1P56177 255 aa2.84□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 NDPQ00604 133 aa2.84□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM27E3Q08E93 113 aa2.84□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 ZADH2Q8N4Q0 377 aa2.84□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 SARAFQ96BY9 339 aa2.84□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 JMJD8Q96S16 334 aa2.84□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 ST20Q9HBF5 79 aa2.84□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa2.84□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa2.84□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa2.84□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM178BH3BS89 294 aa2.84□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 HNF1AP20823 631 aa2.84□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 ATOH7Q8N100 152 aa2.84□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 TEX45Q8NA69 505 aa2.84□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 SHISA9B4DS77 424 aa2.84□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 C16orf97H3BN30 126 aa2.84□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM87AP0C7U9 286 aa2.84□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 USF1P22415 310 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF138P52744 262 aa2.84□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 BAGE2Q86Y30 109 aa2.84□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 VAMP8Q9BV40 100 aa2.84□□□□□ -1.95
PGGT1B-203ENST00000419445 C17orf100A8MU93 164 aa2.84□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATA45Q537H7 98 aa2.84□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF491Q8N8L2 437 aa2.84□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 DPF1Q92782 380 aa2.84□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 NDUFA3O95167 84 aa2.84□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 LTC4SQ16873 150 aa2.84□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 GRAMD2BQ96HH9 432 aa2.84□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PPR1 153 aa2.84□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 M0R3E3 92 aa2.84□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 CNTFRP26992 372 aa2.84□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 RTL8BQ17RB0 113 aa2.84□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 PDPNQ86YL7 162 aa2.84□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 CLEC5AQ9NY25 188 aa2.84□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 SIGLEC9Q9Y336 463 aa2.84□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 OTOGQ6ZRI0 2925 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 PLAUP00749 431 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 NBEAP1P0C6P0 100 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 ARMS2P0C7Q2 107 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV1-8P0DP01 117 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 RBPJQ06330 500 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 EBI3Q14213 229 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 PMCHL1Q16048 86 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4A5Q8NH83 315 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 HIVEP1P15822 2718 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 C20orf202A1L168 122 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 HAX1O00165 279 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 CCL8P80075 99 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4C13Q8NGP0 309 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 HARBI1Q96MB7 349 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM70Q9BUB7 260 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 C11orf21Q9P2W6 132 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 ODF3BA8MYP8 253 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 SAP30LQ9HAJ7 183 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 PLEKHA3Q9HB20 300 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB31Q13636 194 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 SGK494Q96LW2 274 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 OR7C2O60412 319 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 PSG1P11464 419 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 BAGE3Q86Y29 109 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 ABHD17AQ96GS6 310 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2T8A6NH00 312 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4C46A6NHA9 309 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM186Q96B77 213 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A17O43808 307 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 PMCHP20382 165 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 LGALS7P47929 136 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 UBE2G1P62253 170 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 HBBP68871 147 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 LEMD1Q68G75 181 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 PAXXQ9BUH6 204 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 INSIG2Q9Y5U4 225 aa2.83□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 APCSP02743 223 aa2.82□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 CEACAM3P40198 252 aa2.82□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 KRTDAPP60985 99 aa2.82□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa2.82□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 ABI3Q9P2A4 366 aa2.82□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 hDV102S1A0JD36 115 aa2.82□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 CDSNQ15517 529 aa2.82□□□□□ -1.96
PGGT1B-203ENST00000419445 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
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