RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 RPH3ALQ9UNE2 315 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM223BA6NKX1 122 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 S100PP25815 95 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 TOMM20LQ6UXN7 152 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 C9orf139Q6ZV77 190 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM223AQ8IWN6 122 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP5-204ENST00000412806 OR10G8Q8NGN5 311 aa16.74■□□□□ 0.27
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SH3BP5-204ENST00000412806 C5orf17Q8NAS9 161 aa16.73■□□□□ 0.27
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SH3BP5-204ENST00000412806 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
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SH3BP5-204ENST00000412806 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP5-204ENST00000412806 KLF12Q9Y4X4 402 aa16.69■□□□□ 0.26
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SH3BP5-204ENST00000412806 PDZD2O15018 2839 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP5-204ENST00000412806 S100A9P06702 114 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
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SH3BP5-204ENST00000412806 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP5-204ENST00000412806 PRDM13Q9H4Q3 707 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP5-204ENST00000412806 BUB3O43684 328 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP5-204ENST00000412806 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP5-204ENST00000412806 IL17RELQ6ZVW7 336 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP5-204ENST00000412806 GPR82Q96P67 336 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP5-204ENST00000412806 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SH3BP5-204ENST00000412806 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa16.62■□□□□ 0.25
SH3BP5-204ENST00000412806 LTAP01374 205 aa16.62■□□□□ 0.25
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