RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401088.8

SZRD1-201, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SZRD1, Length 3,636 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF714Q96N38 554 aa9.92□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 PTPRSQ13332 1948 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 MZT1Q08AG7 82 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 CD177Q8N6Q3 437 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 ITLN1Q8WWA0 313 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 DUSP23Q9BVJ7 150 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF492Q9P255 531 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 UFC1Q9Y3C8 167 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 CADP27708 2225 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 C15orf65H3BRN8 121 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 IGKCP01834 107 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 C10orf55Q5SWW7 151 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 HES7Q9BYE0 225 aa9.91□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 TGFAP01135 160 aa9.9□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 LEPP41159 167 aa9.9□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 CEND1Q8N111 149 aa9.9□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 RPEQ96AT9 228 aa9.9□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.9□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.9□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.9□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 PCNX2A6NKB5 2137 aa9.9□□□□□ -0.82
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM213A2RRL7 107 aa9.9□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 IQCF6A8MYZ5 107 aa9.9□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 RBP4P02753 201 aa9.9□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 CFIP05156 583 aa9.9□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 PATE2Q6UY27 113 aa9.9□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.9□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 A0A1B0GW15 77 aa9.89□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 MT-ATP8P03928 68 aa9.89□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 GAGE5Q13069 117 aa9.89□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 GAGE6Q13070 117 aa9.89□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 GCSAMQ8N6F7 178 aa9.89□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 NDUFS7O75251 213 aa9.89□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 C12orf74Q32Q52 190 aa9.89□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 TTC32Q5I0X7 151 aa9.89□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 PRSS22Q9GZN4 317 aa9.89□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 HIGD1AQ9Y241 93 aa9.89□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 Q86TA4 180 aa9.89□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 MOGAT3Q86VF5 341 aa9.89□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 PRR7Q8TB68 274 aa9.89□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 SPRY3O43610 288 aa9.88□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 DPM2O94777 84 aa9.88□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 IL11RAQ14626 422 aa9.88□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.88□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF502Q8TBZ5 544 aa9.88□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 MYOZ3Q8TDC0 251 aa9.88□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 FAM201AQ5SY85 155 aa9.88□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 OR10X1Q8NGY0 326 aa9.88□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 TNFRSF1AP19438 455 aa9.88□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 SMIM20Q8N5G0 67 aa9.88□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 GLMPQ8WWB7 406 aa9.88□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 WNK2Q9Y3S1 2297 aa9.88□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 CEP250Q9BV73 2442 aa9.88□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 C19orf71A6NCJ1 209 aa9.87□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 NDUFA3O95167 84 aa9.87□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.87□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 ZNRD1Q9P1U0 126 aa9.87□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 TANC2Q9HCD6 1990 aa9.87□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 FOXI1Q12951 378 aa9.87□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 PSMG4Q5JS54 123 aa9.87□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 MLST8Q9BVC4 326 aa9.87□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa9.87□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 E9PLD3 99 aa9.87□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 Q6AWC8 147 aa9.87□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 LTBP2Q14767 1821 aa9.86□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 PRSS29PA6NIE9 313 aa9.86□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 EVI2AP22794 236 aa9.86□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 HERV-K104P63124 156 aa9.86□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 TRAV40A0A0B4J280 105 aa9.86□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 NPIPB5A8MRT5 1133 aa9.86□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 OR11H12B2RN74 326 aa9.86□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 ORM1P02763 201 aa9.86□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 OR11H1Q8NG94 326 aa9.86□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 OR11H2Q8NH07 326 aa9.86□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 OTORQ9NRC9 128 aa9.86□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 PSG8Q9UQ74 426 aa9.86□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 KLF12Q9Y4X4 402 aa9.86□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 CACNA1EQ15878 2313 aa9.86□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 GATA3P23771 443 aa9.86□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 LYRM7Q5U5X0 104 aa9.86□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 FAM104BQ5XKR9 115 aa9.86□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 C7orf69Q9H7B7 122 aa9.86□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 AAMDCQ9H7C9 122 aa9.86□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 EXPH5Q8NEV8 1989 aa9.85□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 TMEM8BA6NDV4 472 aa9.85□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa9.85□□□□□ -0.83
SZRD1-201ENST00000401088 SNCGO76070 127 aa9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms